طراحی پرایمر اختصاصی ردیابی ژنوتیپ QX ویروس برونشیت عفونی پرندگان

  • سال انتشار: 1398
  • محل انتشار: چهارمین همایش بین المللی افق های نوین در علوم کشاورزی، منابع طبیعی و محیط زیست
  • کد COI اختصاصی: AHCONF04_096
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 634
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

فاطمه یازرلو

دکتری حرفه ای دامپزشکی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تهران

وحید کریمی

دانشیار (Ph.D.)، عضو هیئت علمی دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تهران

آرش قلیان چی لنگرودی

دانشیار (Ph.D.)، عضو هیئت علمی دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تهران

چکیده

تحقیق حاضر به منظور طراحی آغازگر اختصاصی ردیابی ژنوتیپ QX ویروس برونشیت عفونی پرندگان انجام گرفت. استخراج توالی ژنS1 ویروس QX از بانک جهانی ژن انجام گرفت. بر اساس خروجی همردیفی ناشی از سویه های QX، ماساچوست، واریانت 2 و B/793 ناحیه های اختصاصی برای QX توسط نرم افزار بیوانفورماتیکی CLC شناسایی شدند؛ و پرایمر آن طراحی و ساخته شد. استخراج RNA ویروسی با استفاده از کیت Cinna Pure RNA (شرکت سیناکلون- ایران) انجام شد. پرایمر طراحی شده اختصاصا قادر به شناسایی واریانت QX بوده و نمونه های دیگر که سایر واریانتهای برونشیت بود نتیجه منفی داشته و به وسیله پرایمر مورد بررسی، قابل شناسایی نبوده است. طول باند به دست آمده 660 جفت باز بود. نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که میتوان از آغازگر طراحی شده جهت شناسایی و پیشبینی وجود واریانت QX برونشیت عفونی پرندگان در گله های مرغ گوشتی به روش RT-PCR استفاده نمود.

کلیدواژه ها

طراحی پرایمر، ارزیابی RT-PCR، ردیابی ژنوتیپ QX ، برونشیت عفونی، پرندگان

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.