شناسایی ژنتیکی و طبقه بندی آرتمیای ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
- سال انتشار: 1394
- محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 7، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_JOAGK-7-3_010
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 395
نویسندگان
چکیده
در این پژوهش، تنوع ژنتیکی جمعیت آرتمیا اورمیانا و آرتمیا فرانسیسکانای موجود در ایران با استفاده از 5 جفت آغازگر ریزماهوارهای (Af-B105TAIL، Af-A136، Apdq03TAIL، Apdq04TAIL و Apdq05TAIL) ویژهی آرتمیا فرانسیسکانا و آرتمیا پارتنوژنتیکا بررسی شد. DNA ژنومی 50 سیست آرتیمیا از هر جمعیت به صورت انفرادی و با روش گلولهی داغ استخراج شد. محصولات PCR با استفاده از 5 جفت آغازگر با موفقیت تکثیر و فرآوردههای حاصل بر روی ژل پلی اکریل آمید واسرشتهساز 6% الکتروفورز شده و با روش نیترات نقره رنگ آمیزی گردیدند. تمامی جایگاهها چندشکل بودند. میانگین تعداد آللها و محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC) برای جمعیت آرتمیا فرانسیسکانا و آرتمیا اورمیانا بهترتیب برابر با 3، 5428/0 و 5/2، 3833/0 بود. در آرتمیا اورمیانا تمامی جایگاهها در تعادل هاردی-وینبرگ قرار داشتند، در حالی که در آرتمیا فرانسیسکانا تنها جایگاه Af-A136 در تعادل هاردی-وینبرگ قرار داشت. میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار برای آرتمیا فرانسیسکانا و آرتمیا اورمیانا بهترتیب 6209/0 و 4531/0 محاسبه شد. دندروگرام فیلوژنتیکی در داخل جمعیتها براساس فاصلهی ژنتیکی و با استفاده از روش UPGMA ترسیم گردید. براساس تعداد آللها و فراوانی آنها در جمعیت آرتمیاهای مورد بررسی میتوان دریافت که این جمعیتها از ترکیب ژنتیکی مناسبی برخوردار هستند.کلیدواژه ها
آرتمیا, تنوع ژنتیکی, چند شکلی, ریز ماهواره, هتروزیگوسیتیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.