ارزیابی فنوتیپی و ژنوتیپی برخی جدایه های باکتری عامل بیماری خوشه صمغی گندم و جو در ایران
- سال انتشار: 1395
- محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 8، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_JOAGK-8-1_010
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 429
نویسندگان
دانشجوی سابق کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
استاد گروه گیاهپزشکی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
چکیده
بیماری خوشه صمغی از بیماری های گندم در مناطق متعددی از کشت این محصول در ایران می باشد. گونه Rathayibacter iranicus به عنوان عامل این بیماری بر روی گندم و جو تاکنون فقط از ایران گزارش شده است. به منظور ارزیابی تنوع احتمالی جدایه های گونه ی R. iranicus و نیز مشخص تر نمودن موقعیت تاکسونومیکی جدایه های عامل بیماری در جو نمونه هایی از استان های آذربایجان شرقی، ایلام، اصفهان، فارس و خوزستان جمع آوری و کشت شد. بر اساس نتایج آزمون های بیوشیمیایی و نقوش الکتروفورزی پروتئین های سلولی، پانزده جدایه به عنوان نماینده برای بررسی های ژنوتیپی انتخاب شدند. برای تعیین میزان تنوع و ارتباط ژنتیکی جدایه ها، DNA ژنومی نماینده ها با آغازگرهای ریز ماهواره ای M13 و 5(GTG) تکثیر شد. قطعه ژن های خانه دار شامل 16S rDNA، recA و gyrB و همچنین ناحیه ITS تعدادی از جدایه ها تکثیر و توالی یابی شد. نتایج تعدادی از آزمون های افتراقی فنوتیپی با آنچه در منابع قبلی ذکر شده بود مطابقت نداشت. نتایج حاصل از بررسی تنوع ژنتیکی به وسیله ی ریز ماهواره ها حاکی از وجود تنوع در بین جدایه ها بود. مقایسه ی ترکیبی نقوش حاصل از این آغازگرها شباهت بالایی را بین جدایه ها و جدایه ی مرجع R. iranicus نشان داد. جدایه های جو نیز در شاخه ای مجزا ولی نزدیک به گروه جدایه ی R. iranicus و در فاصله ای دور از دو گونه ی R. tritici و R. rathayi قرار گرفتند. مقایسه توالی های به دست آمده از ژن های ITS، 16SrDNA، gyrB و recA با توالی های موجود در ژن بانک نشانگر بیشترین شباهت جدایه های گندم و جو به R. iranicus بودکلیدواژه ها
خوشه صمغی, Rathayibacter, ریز ماهواره, ژن های خانه داریاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.