روش تاپسیس جدید مبتنی بر معیار فاصله ماهالانوبیس و آنتروپی رنی برای انتخاب ژن های بهینه در تشخیص بیماری سرطان

در چند دهه اخیر تحولات گسترده ای با تلفیق علوم و فناوری درزمینه گوناگون ازجمله علوم زیستی صورت گرفته کهدرجهت کمک به محققین علوم پایه زیستی و بالینی در درک صحیح فیزیولوژی انسان و کشف تغییرات مولکولی می باشد، یکی از اینفن آوری های کاربردی ریزآرایه است. تحلیل و طبقه بندی داده های میکرو آرایه یکی از موضوعات چالش برانگیز درزمینه علم بیوانفورماتیک می باشد. یکی از موارد استفاده از نتایج تحلیل داده های میکرو آرایه پیش بینی، تشخیص و درمان بیماری های بسیاری به خصوص بیماری های سرطانی است. از مشکلاتی که در رابطه با داده های میکرو آرایه وجود دارد، ابعاد بسیار بالا (تعداد ژن زیاد) در برابر تعداد کم نمونه ها است که این عامل باعث بروز مشکلات و چالش های بسیاری درزمینه تحلیل داده های بیان ژن می شود. به این منظور در این پژوهش از الگوریتم تاپسیس بهبودیافته جهت انتخاب ژن استفاده گردید. با توجه به نوع داده های این پژوهش و برای بالا بردن دقت تاپسیس از آنتروپی رنی و الگوریتم فاصله ماهالانوبیس استفاده شده است. نتایج حاصل شده نشان دهنده این است که داده های ژنی به دست آمده از الگوریتم تاپسیس جدید همراه با دسته بند SVM از دقت بالایی نسبت به برخی از روشهای کارشده برخورداراست به طوریکه دقت تشخیص در داده های 97.35Lymphoma است.

کلیدواژه ها:

سرطان ، میکرو آرایه ، انتخاب ژن ، تاپسیس ، ماهالانوبیس ، آنتروپی رنی