Feature selection for Protein Fold Recognition using Vortex search algorithm

  • سال انتشار: 1397
  • محل انتشار: سومین کنفرانس سیستم های تصمیم گیری هوشمند
  • کد COI اختصاصی: IDS03_041
  • زبان مقاله: انگلیسی
  • تعداد مشاهده: 444
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

Elham Hekmatnia

Department of Computer Engineering, School of Engineering, Azad University, Science and Research Branch.

Hedieh Sajedi

Department of Computer Science, School of Mathematics, Statistics and Computer Science, College of Science, University of Tehran

Ali Habib Agahi

Department of Computer Engineering, School of Engineering, Azad University, South Tehran Branch

چکیده

Feature selection is one of the most important steps of pre-processing data, which aims to select a subset of relevant features. On the other hand, extracting effective features is one of the challenges in protein fold recognition. In this paper, we propose a feature selection method based on Vortex Search Algorithm (VSA). In addition, Map/Reduce framework has been implemented as a speedup technique to feature selection. In the proposed method, in each step of map function, VSA is employed to find an optimization subset of features, and map and reduce functions are executed in parallel mode. Finally, we evaluated the proposed method in classification of a benchmark dataset for protein fold recognition. The experimental results indicate that the proposal method improves prediction accuracy by ~10%.

کلیدواژه ها

feature selection, vortex search algorithm, Map/Reduce, protein folding recognition

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.