CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

مطالعه خصوصیات فیزیکی سه سویه گلوکوآمیلاز به کمک شبیه سازی دینامیک مولکولی

عنوان مقاله: مطالعه خصوصیات فیزیکی سه سویه گلوکوآمیلاز به کمک شبیه سازی دینامیک مولکولی
شناسه ملی مقاله: NCNCMB03_117
منتشر شده در سومین کنفرانس ملی تازه های سلولی مولکولی و اولین سمپوزیوم بین المللی ژنو میکس و پروتئومیکس در سال 1396
مشخصات نویسندگان مقاله:

آذین مشرف قهفرخی - گروه زیست شناسی سلولی و مولکولی، دانشکده شیمی، دانشگاه کاشان، کاشان، ایران
کریم مهنام - گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران
حسینعلی رفیعی پور - گروه زیست شناسی سلولی و مولکولی، دانشکده شیمی، دانشگاه کاشان، کاشان، ایران

خلاصه مقاله:
گلوکوآمیلاز، یک آنزیم مهم اقتصادی به دلیل توانایی اش در هیدرولیز نشاسته و پلیمرهای مربوط به بتادیگلوکز است. پایداری حرارتی آنزیمها در دماهای بالا و همچنین مقاومت آنزیم ها در دماهای پایین اهمیت ویژه ای در کاربردهای صنعتی دارد. فهم عوامل موثر در گرمادوستی یا سرمادوستی آنزیم گلوکوآمیلاز در توسعه آنزیمهایی با مقاومت گرمایی یا سرمایی بالا ضروری است. در این مطالعه به کمک شبیه سازی دینامیک مولکولی با زمان شبیه سازی بیست نانوثانیه برای هر کدام از سویه های گلوکوآمیلاز در چهار دمای 300، 350، 400 و 450 کلوین یک سری از خصوصیات فیزیکی اعم از تعداد پیوند هیدروژنی داخل پروتیین وتعداد پیوند هیدروژنی بین پروتیین و آب، مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصل از این بررسی نشان داد که افزایش دما از 300 به 450 کلوین بیشترین پایداری را در سویه سرمادوست ایجاد کرده است. همچنین نتایج ساختار دوم سه سویه از طریق الگوریتم DSSP نتایج بالا را تایید می کند.

کلمات کلیدی:
آنزیم گلوکوآمیلاز، پیوند هیدروژنی داخلی، پیوند هیدروژنی پروتیین و آب، شبیه سازی دینامیک مولکولی

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/783350/