ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
CIVILICAWe Respect the Science
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
عنوان
مقاله

IDENTIFICATION OF A NEW SMALL MOLECULE FROM TAXUS BACCATA PLANT AS A POTENTIAL INHIBITOR OF VIRB8 OF BRUCELLA BACTERIA BY HIGH-THROUGHPUT VIRTUAL SCREENING ON TRADITIONAL CHINESE MEDICINE DATABASE

تعداد صفحات: 1 | تعداد نمایش خلاصه: 157 | نظرات: 0
سال انتشار: 1397
کد COI مقاله: MEDISM19_213
زبان مقاله: انگلیسی
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

مشخصات نویسندگان مقاله IDENTIFICATION OF A NEW SMALL MOLECULE FROM TAXUS BACCATA PLANT AS A POTENTIAL INHIBITOR OF VIRB8 OF BRUCELLA BACTERIA BY HIGH-THROUGHPUT VIRTUAL SCREENING ON TRADITIONAL CHINESE MEDICINE DATABASE

Seyede Solmaz Moosavian - Dept. of Biology, Faculty of Science, University of Sistan and Baluchestan
Milad Lagzian - Dept. of Biology, Faculty of Science, University of Sistan and Baluchestan
Malihe Mohammadi - Dept. of Biology, Faculty of Science, University of Sistan and Baluchestan

چکیده مقاله:

Background and Aim:The type IV secretion system (T4SS) is one the most important virulence factor of Brucella. VirB8 is a central assembly factor for all type IV secretion systems. Thus, it can be a potential target for novel antimicrobial drugs.Methods:In this study, a database with more than 57,000 active compounds originating from medicinal plants of China was used for high-throughput virtual screening against VirB8. Ligand preparation was done by Discovery Studio 2017 to optimize valance, charges and tautomeric form created for each ligand which finally made the library with more than 229656 records. Afterward, receptor preparation was conducted on CLC Drug Discovery 4.0 to prepare the structure of 4AKZ. Active Site Mapping was used based on the previous reports to identify key catalytic residues. Docking was accomplished in a pipeline with an increasing level of precision including HTVS (output: 5731), SP (output: 54) and finally XP (output: 6) by Screen Ligands module in CLC Drug Discovery 4.0. To select the final candidate, the output of the XP step was re-evaluated using more sophisticated MM-GBSA scoring.Results:The compound 6439 that originated from Taxus baccata plant, was the best selection as ultimate hit for VirB8 inhibition. This molecule can strongly interact with key residues, Q144 and K182, of VirB8 via hydrogen bonding and ionic interactions.Conclusion:For the final evaluation, a Molecular Dynamics simulation will be conducted on this ligand and if a satisfactory result obtains, the ligand will be synthesized and in-vitro experiments will perform.

کلیدواژه ها:

Brucella, High-Throughput Virtual Screening, VirB8, Inhibitor

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/782552/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Moosavian, Seyede Solmaz و Lagzian, Milad و Mohammadi, Malihe,1397,IDENTIFICATION OF A NEW SMALL MOLECULE FROM TAXUS BACCATA PLANT AS A POTENTIAL INHIBITOR OF VIRB8 OF BRUCELLA BACTERIA BY HIGH-THROUGHPUT VIRTUAL SCREENING ON TRADITIONAL CHINESE MEDICINE DATABASE,نوزدهمین کنگره بین المللی میکروب شناسی ایران,تهران,,,https://civilica.com/doc/782552

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1397, Moosavian, Seyede Solmaz؛ Milad Lagzian و Malihe Mohammadi)
برای بار دوم به بعد: (1397, Moosavian؛ Lagzian و Mohammadi)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

علم سنجی و رتبه بندی مقاله

مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
نوع مرکز: دانشگاه دولتی
تعداد مقالات: 9,293
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

مقالات مرتبط جدید

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

پشتیبانی