بیوانفورماتیک و توالی یابی نسل جدید در علوم کشاورزی: موقعیت کنونی، مسیرها و چالش های آینده
- سال انتشار: 1397
- محل انتشار: چهارمین کنفرانس بین المللی یافته های نوین در علوم کشاورزی، منابع طبیعی و محیط زیست
- کد COI اختصاصی: NEWCONF04_190
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 3036
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد پژوهشکده زیست فناوری، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران
دانشجوی کارشناسی ارشد پژوهشکده زیست فناوری، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نژاد دام، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران.
چکیده
امروزه علم بیوانفورماتیک نقش کلیدی و مهمی در پیشرفت و فهم علوم زیستشناسی دارد. تحقیقات زیادی توسط محققان برای نوآوری در بسیاری از جنبه های علوم کشاورزی و بهبود آن صورت گرفته که یکی از زمینه های تحقیقاتی جدید، استفاده از علم بیوانفورماتیک در علوم کشاورزی است. در واقع تغییرات در محیطزیست برای بهبود حیوانات، گیاهان و دنیای میکروبی که در تغذیه و سلامت جوامع انسانی نقش دارند، نیازمند به درک مکانیسم های مولکولی، ساختار و عملکرد جمعیتها و جوامع دارد. برای افزایش سطح دانش و بهبود قدرت پیشبینی در مورد مولکولها و مکانیسم های مرتبط با صفات فنوتیپی خاص و پاسخهای خاص به تنش های زیستی و غیر زیستی از بیوانفورماتیک استفاده میشود. استفاده از بیوانفورماتیک در علوم کشاورزی باعث ایجاد روشهای جدیدی در تشخیص، کنترل و ردیابی، کاهش هزینه ها، کشف اطلاعات جدید و مفیدی در مورد تنظیم بیان ژن در سطح سلول و گیاه، آنالیز ژن های مهم در واکنشهای دفاعی گیاهان در برابر پاتوژن و تحمل استرسهای محیطی می گردد. در ده هی گذشته توالی یابی نسل جدید (NGS) توانسته اطلاعات مفیدی در مورد ژنوم محصولات کشاورزی و تنظیم ژن آنها ارایه کند. این تکنیکها دارای یک پتانسیل خیلی مناسب برای تحقیقات آنالیز متاژنوم و تحقیقات کشاورزی میباشد و چشمانداز مناسبی برای اصلاح گیاهان ایجاد کرده است. تکنیک NGS اطلاعات مفید و کاربردی در مورد تنظیم بیان ژن در تک سلول یا کل گیاه در واکنشهای زیستی و غیر زیستی را از طریق توالی یابی RNA ارایه میکند. تعیین ساختار ژنتیکی به وسیله توالی یابی و تکثیر کامل ژنوم منجر به توسعهی نشانگرهای ملکولی مناسب برای مطالعات ژنتیکی و اصلاح نباتات و همچنین ایجاد نقشه ی ژنتیکی دقیق از ژن های هدف شده است. تعیین ساختار ژنتیکی گیاهان و انتخاب ژنهای مقاوم به تنشهای محیطی و پاتوژنها، باعث بهبود تولید محصولات کشاورزی میشود. در این مقاله ما به نقش و اهمیت بیوانفورماتیک و به ویژه توالی یابی نسل جدید (NGS) و تاثیرات آن بر روی مطالعه ی ژنوم، رونویسی و بیان ژنها و متاژنوم در علوم کشاورزی میپردازیم.کلیدواژه ها
کشاورزی نوین، متاژنوم، توالی یابی ژنوم، .NGSمقالات مرتبط جدید
- بررسی تنوع زیستی گیاهان مرتعی ارتفاعات کبیرکوه در جنوب دره شهر (استان ایلام)
- عوامل موثر بر میزان پیچان رودخانه های خرم اباد
- ارزیابی کیفیت آب شرب گاوهای شیری در گاوداری های صنعتی حومه مشهد از نظر وجود فلزات سنگین، نیترات و سولفات
- بیو پلیمر پلی ساکاریدی برای مصارف دامپزشکی
- راهکارهای کارآمد کاهش انتشار گازهای گلخانه ای از طریق فناوری کشاورزی هوشمند
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.