بهینه سازی تشخیص کوکساکی ویروس B3 با استفاده از تکنیک RT-LAMP به کمک روش تاگوچی

  • سال انتشار: 1396
  • محل انتشار: هفتمین همایش سراسری پدافند جنگ های نوین
  • کد COI اختصاصی: NBCCON07_052
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 793
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

آریا منزه

پژوهشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه صنعتی مالک اشتر

مهدی زین الدینی

پژوهشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه صنعتی مالک اشتر

شاداب جبارزاده

علیرضا سعیدی نیا

چکیده

مقدمه : ویروس کوکساکی (CVB3) B3 به عنوان یک ویروس پاتوژن عامل میوکارد ویروسی است و به عنوان یک عامل بیولوژیک خطرناک دسته بندی می گردد که قابلیت تسلیحاتی شدن را نیز داراست. در این مطالعه تشخیص CVB3 با استفاده از بهینه سازی یک و دو مرحله ای تکنیک RT-LAMP (رونویسی معکوس تکثیر هم دما وابسته به لوپ) به روش تاگوچی مورد سنجش قرارگرفت.مواد و روش ها: به منظور طراحی آزمایشات تاگوچی و شرح تعداد موقعیت های مختلف آزمایش ها، از نرم افزار Qualitek-4 استفاده گردید. بهینه سازی یک و دو مرحله ای تکنیک RT-LAMP در 9 آزمایش با شرایط متفاوت طراحی شد و با استفاده از سه فاکتور متغییر غلظت MgSO4 ، دما و زمان انکوباسیون انجام شد.یافته ها: نتایج نشان داد که در واکنش یک مرحله RT-LAMP ، شرایط 4 میلی مولار MgSO4 و 60 درجه سانتی گراد به مدت 90 دقیقه انکوباسیون، نتایج بهتری برای شناسایی CVB3 نشان می دهد. اما در واکنش دو مرحله RT-LAMP بهترین داده ها در سه آزمایش: 2 میلی مولار MgSO4 ، 63 درجه سانتیگراد برای 40 دقیقه انکوباسیون و 4 میلی مولار MgSO4 ، 63 درجه سانتیگراد برای 60 دقیقه انکوباسیون و 4 میلی مولار MgSO4 ، 65 درجه سانتی گراد برای 20 دقیقه انکوباسیون بوده است. از سوی دیگر، نتایج نشان داد که هر دو آزمایش RT-LAMP اختصاصی بوده است و حساسیت واکنش یک و دو مرحله RT-LAMP به ترتیب در حدود fg RNA 10 / μl و cDNA 0.572fg / μl تعیین شد.نتیجه گیری: این داده ها نشان دادند که یک و دو مرحله RT-LAMP روشی ساده، اختصاصی و حساس برای تشخیص عفونت CVB3 می باشند. بنابراین از سنجش بهینه شده RT-LAMP می توان در تشخیص ویروس های پاتولوژیک (که امکان تسلیحاتی شدن دارند)، استفاده نمود.

کلیدواژه ها

تاگوچی،عامل بیولوژیک،RT-LAMP،ویروس کوکساکی .B3

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.