ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
CIVILICAWe Respect the Science
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
عنوان
مقاله

غربالگری مجازی با کارایی بالا در پایگاه گیاهان دارویی چین درجهت کشف ترکیبات آگونیستی برای گیرنده های شبه تول 4 انسانی (TLR4)

تعداد صفحات: 1 | تعداد نمایش خلاصه: 348 | نظرات: 0
سال انتشار: 1395
کد COI مقاله: BIOC01_189
زبان مقاله: فارسی
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

مشخصات نویسندگان مقاله غربالگری مجازی با کارایی بالا در پایگاه گیاهان دارویی چین درجهت کشف ترکیبات آگونیستی برای گیرنده های شبه تول 4 انسانی (TLR4)

مبینا عظیمی - دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان
بهرام ملکی زنجانی - دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان
عباس بهاری - گروه بیوتکنولوژی، پژوهشکده فناوری های نوین زیستی، دانشگاه زنجان
میلاد لگزیان - گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه سیستان و بلوچستان

چکیده مقاله:

گیرنده های شبهتول ) TLRs ( پروتیین هایی نعلی شکلی اند که در سیستم ایمنی جانوران عالی بخصوص انسان هستند که دارای دومین خارج سلولی متشکل از 25 - 18 کپی غنی از لوسین ) LLR ( میباشند که با اتصال به لیگاند، دایمر شده و پاتوژن را شناسایی میکند. این گیرنده های تشخیص دهندهی توالی های الگو ) PRRs ( توسط تعداد زیادی از سلولها شامل ماکروفاژها، سلولهای دندریتیک، سلولهای B و سلولهای اپیتلیال خاص بیان میشوند و شروع پاسخهای ایمنی ذاتی علیه عوامل میکروبی و عفونت را در بافتها ممکن میسازد. با توجه به اهمیت TLR4 در بحث التهاب، ،دستهایی از داروهای فعال کننده این گیرنده و مسیر پیام رسان آن در درمان عفونتهای حادیا در برانگیختن سیستم ایمنی و درمان سرطان نقش مهمی ایفا میکنند. از اینرو شناسایی ترکیبات دارویی فعال کننده ی این پروتیین بخصوص با منشاء گیاهی میتواند بسیار مفید باشد. بدین منظور، از تکنیک غربالگری مجازی با کارایی بالا ) High Throughput Virtual Screening ( بر روی ترکیبات موجود در بانک اطلاعاتی TCM استفاده شد. TCM بانک اطلاعاتی با بیش از 57000 ترکیب فعال استخراج شده از گیاهان دارویی است. در ابتدا، آماده سازی کتابخانه ی لیگاندها توسط نرم افزار BIOVIA Discovery Studio 2016 انجام شد، در این روند ابتدا بار وضعیت والانس ترکیبات اصلاح گردیدند و تاتومرهای هر لیگاند تولید و به فرم سه بعدی تبدیل شد )در مرحله ی نهایی آماده سازی جمعیت کتابخانه به 229656 رکورد رسید(. سپس آماده سازی گیرنده )شماره دسترسی 4G8A ( که شامل حذف مولکولهای آب، بهینه سازی ساختار و به حداقل رساندن انرژی بود توسط ماژول LigPrep نرم افزار 2- Schrodinger2015 با استفاده از میدان نیرو OPLS2005 انجام گردید. به منظور انجام غربالگری مجازی با استفاده از مطالعات قبلی، تهیه ی گرید داکینگ Active Site Mapping انجام و نهایتا تعیین رزیدوهای کلیدی کاندید برای پیوندهای هیدروژنی با لیگاندها انجام گرفت. داکینگ با سه مرحله ی گزینشی HTVS )با خروجی 2463 رکورد(، SP )با خروجی 1692 ( و در آخر XP )با خروجی 216 رکورد( توسط ماژول Glide در نرم افزار Schrodinger 2015 صورت پذیرفت. جهت تعیین بهترین لیگاندهای متصل شونده ) 216 ، )Lead رکورد حاصله از مرحله نهایی در سه نرمافزار ICM-Pro ،CLC Drug Discovery ،MOE داک گردید و میانگین بهترین نمره در چهار نرم افزار به عنوان راهنما برای انتخاب یک کاندیدای آگونیست برای فعال سازی TLR4 در آنالیزهای برونتن در کشت PBMCs انسانی قرار گرفت. نتایج بدست آمده هر چند در مرحله مقدماتی است اما بسیار امیدوار کننده است.

کلیدواژه ها:

غربالگري مجازي با كارايي بالا، گياهان دارويي، TLR4

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/731858/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
عظیمی، مبینا و ملکی زنجانی، بهرام و بهاری، عباس و لگزیان، میلاد،1395،غربالگری مجازی با کارایی بالا در پایگاه گیاهان دارویی چین درجهت کشف ترکیبات آگونیستی برای گیرنده های شبه تول 4 انسانی (TLR4)،اولین کنفرانس ملی یافته های نوین زیست شناسی،زاهدان،،،https://civilica.com/doc/731858

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1395، عظیمی، مبینا؛ بهرام ملکی زنجانی و عباس بهاری و میلاد لگزیان)
برای بار دوم به بعد: (1395، عظیمی؛ ملکی زنجانی و بهاری و لگزیان)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

علم سنجی و رتبه بندی مقاله

مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
نوع مرکز: دانشگاه دولتی
تعداد مقالات: 7,863
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

مقالات مرتبط جدید

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

پشتیبانی