مقایسه روش های مختلف استخراج RNA در سیب Malus domestica

  • سال انتشار: 1394
  • محل انتشار: نهمین کنگره علوم باغبانی ایران
  • کد COI اختصاصی: BAGHBANI09_645
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 332
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

شهرام منتظری

دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات، دانشگاه آزاد اسلامی، اهواز

شهاب سادات

استاد گروه اصلاح نباتات، دانشگاه آزاد اسلامی، اهواز

چکیده

جداسازی RNA از گیاهانی که دارای مقدار زیادی ترکیبات پلی ساکارید و پلی فنل میباشند به علت اتصال و رسوب این ترکیبات با RNA مشکل است. بنابراین در این مطالعه 11 پروتکل مختلف استخراجRNA از برگهای سیب مورد بررسی قرار گرفت. کیفیت RNA از باندهای 18s,28s rRNA با الکتروفورز ژل آگارز 1،2% بررسی گردید. کمیت و خلوص RNA استخراجی با اسپکتروفتومتری در طول موج 230و260و280 نانومتر و نسبت جذب A230/A280 و 260 A260/A تعیین شد. همچنین برای بررسی کیفیت RNA استخراجی سنتز cDNAوآنالیز RT-PCR با پرایمر اختصاصی ژن اکتین سیب انجام گرفت. نتایج نشان داد که روش استخراج جمی چات چایو و همکاران 2012 و راجاکانی و همکاران 2013 مناسبترین روش های استخراج RNA از سیب بودند. عملکرد RNA کل استخراج شده با روش جمی چات چایو و همکاران 2012 و روش راجاکانی و همکاران 2013 به ترتیب بین 152،4تا800،2 نانوگرم در میکرولیتر و362،1تا452،6 نانوگرم در میکرولیتر بدست آمد. در هر دو روش نسبت 260به280 و230به260 به ترتیب بین 1،99تا2،03 و2،07و2،17 بود که نشان داد RNA خلوص بالایی داشته و فاقد آلودگی پلی فنلی، پروتیینی و پلی ساکاریدی می باشد. باندهای 18Sو28S در الکتروفورز افقی مشاهده شدند. همچنین کیفیت بالای واکنش RT-PCR در هر دو روش نشان میدهد که RNA استخراج شده میتواند با اطمینان جهت آزمایش های مولکولی پایین دستی مورد استفاده قرار گیرد

کلیدواژه ها

جداسازی RNA،سیب،RT-PCR

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.