Design of GST Target-Specific Primers for Polymerase Chain Reaction

  • سال انتشار: 1396
  • محل انتشار: هفتمین همایش بیوانفورماتیک ایران
  • کد COI اختصاصی: IBIS07_023
  • زبان مقاله: انگلیسی
  • تعداد مشاهده: 602
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

Mahsa Ghasemi

Department of Molecular and Cell Biology, Faculty of Basic Sciences, University of Mazandaran, Babolsar, Iran

Ali Taravati

Department of Molecular and Cell Biology, Faculty of Basic Sciences, University of Mazandaran, Babolsar, Iran

Fatemeh Tohidi

Department of Microbiology, Faculty of medicine, Babol University of Medical Sciences, Babol, Iran

Maryam Mohajerani

Department of Microbiology, Faculty of medicine, Babol University of Medical Sciences, Babol, Iran

چکیده

Bioinformatics is a science which may be defined as the interface between biological and computational sciences[1]. This knowledge can find an appropriate response to biological problems, using computational tools and systems. Primer design is one of these problems. Good primer design is one of the most successful steps in realtime PCR[2]. Oligo is an appropriate software for primer design. The sequence design for forward GST with length 22 mer and Tm 58.6 °C is ACT CAA AGC CTC CTG CCT ATA C and for reverse GST with length 21 mer and Tm 58.9 °C is GTC CTT CCC ATA GAG CCC AAG. In primer design several parameters including the length of the primer, %GC content and the 3 sequence is important[3]. A software packages such as Oligo can help to primer design with less troublesome, non-specific amplification or primer-dimer formation, can result in little or no product. For this reason primer design is an important step for a good realtime PCR

کلیدواژه ها

Primer; Design; Glutathione-S Transferase; Realtime PCR

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.