تعیین ساختار سوم پروتیین با استفاده از الگوریتم ژنتیک

  • سال انتشار: 1396
  • محل انتشار: اولین کنفرانس ملی پژوهش های کاربردی درعلوم و مهندسی
  • کد COI اختصاصی: ARSE01_212
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 667
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

زهرا ابوالحسنی فروغی

دانشجوی کارشناسی ارشد کامپیوتر- نرم افزار، گروه کامپیوتر، دانشگاه آزاد اسلامی، مرودشت، ایران

فرزاد پیروی

هیات علمی و دکترای تخصصی کامپیوتر- نرم افزار ، گروه کامپیوتر، دانشگاه آزاد اسلامی، مرودشت، ایران

چکیده

با توجه به نقش و کارکرد حیاتی پروتیین ها در بدن انسان و وابستگی عمل کرد یک پروتیین به ساختار آن پیش بینی ساختار توالی پروتیین اهمیت فوق العاده ای می یابد. تاکنون روش های مختلفی برای این مسیله از قبیل شبکه های عصبی، روش تکاملی مونت کارلو، روش بهینه سازی ازدحام ذرات، بهینه سازی دسته ی زنبوران و الگوریتم ژنتیک ارایه شده است. همچنین در برخی از این الگوریتم ها از خاصیت آب دوستی و آب گریزی اسیدهای آمینه پروتیین ها برای حل مسیله پیش بینی ساختار پروتیین ها استفاده می کنند. دانستن ساختار سوم پروتیین بسیار مهم است چراکه مستقیما به عملکرد آن مرتبط می شود و تمام فعالیت هایی که در سلول انجام می شود بر عهده پروتیین ها است. در این مقاله برای پیش بینی ساختار سوم پروتیین از الگوریتم ژنتیک و الگوریتم K-means استفاده شده است. در این روش یک توالی پروتیین به عنوان ورودی به الگوریتم داده می شود که خروجی آن بهترین تا خوردگی با حداقل انرژی کل تعاملات بین اسید آمینه ها می باشد.

کلیدواژه ها

پیش بینی ساختار سوم پروتیین، الگوریتم ژنتیک، مدل آب دوست-آب گریز، شبکه FCC سه بعدی، الگوریتم خوشه بندی K-means

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.