شبیه سازی ساختار ایمونوتوکسین نوترکیب DT-GCSF اولیه و جهش یافته به منظور اصلاح شرایط بازتاخوردگی
- سال انتشار: 1395
- محل انتشار: نوزدهمین کنگره ملی و هفتمین کنگره بین المللی زیست شناسی ایران
- کد COI اختصاصی: BIOCONF19_555
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 444
نویسندگان
پژوهشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه صنعتی مالک اشتر، تهران، ایران
پژوهشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه صنعتی مالک اشتر، تهران، ایران
پژوهشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه صنعتی مالک اشتر، تهران، ایران
پژوهشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه صنعتی مالک اشتر، تهران، ایران
چکیده
ایمونوتوکسین ها بعنوان نسل جدیدی از درمان هدفمند سلول های سرطانی هستند که در گروه پروتیین های نوترکیب هیبریدی قرار می گیرند و از دو بخش اتصالی و سیتوتوکسیک تشکیل می شوند. ایمونوتوکسین DT-GCSF در واقع همان توکسین دیفتری DT است که بخش اتصالی آن با فاکتور محرک کلنی گرانولوسیت GCSF جایگزین شده است. با توجه به ساختار هیبریدی پروتیین DT-GCSF و به منظور شبیه سازی ساختاری آن در فرم طبیعی و پس از بازتاخوردگی، در این تحقیق با استفاده از نرم افزار Modeller ساختار پروتیین هیبریدی نوترکیب در دو حالت اولیه و جهش یافته ابتدا مدلسازی شد. سپس ساختار دمین خارج سلولی گیرنده GCSF از بانک اطلاعات پروتیین استخراج شد و با استفاده از نرم افزار Hex نسخه 8 عملیات docking هم بین پروتیین اولیه با گیرنده و هم بین پروتیین جهش یافته با گیرنده، انجام شد. نتایج نشان داد که پروتیین اولیه و جهش یافته تفاوت ساختاری ناچیزی با یکدیگر دارند و نتایج docking نیز نشان داد که تفاوتی در اتصال بین پروتیین هیبریدی اولیه و جهش یافته با گیرنده وجود ندارد. با استفاده از نرم افزار SPDB viewer میزان انرژی هر دو پروتیین محاسبه شد که برای فرم اولیه و جهش یافته به ترتیب 14307/284 - و 14575/465- کیلوژول بر مول به دست آمد که نشان می دهد، پروتیین جهش یافته پایدارتر می باشد.کلیدواژه ها
ایمونوتوکسین، شبیه سازی، توکسین دیفتری، فاکتور محرک کلنی گرانولوسیتیمقالات مرتبط جدید
- Molecular Simulation of Water Transport through Polyamide Membrane in K+Cl- Salt Solution
- نانوکامپوزیت ها در دندانپزشکی
- Improving the characteristics of L-shaped graphene-based gas sensor using gold block on the surface
- Molecular Modelling of Gelatin Bundles for Atomistic Investigations Suggesting Two Stable Conformations
- بررسی تاثیر نانوذرات منیزیم بر جوانه زنی بذر و رشد گیاهچه بادرنجبویه Melissa officinalis
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.