بررسی ساختار ژن TLR4 در دو سویه از طیور تجاری لاین آرین و بومی آذربایجان غربی

در این مطالعه، ساختار ژن TLR4 به عنوان گیرنده اصلی در شناسایی لیپوپلی ساکارید باکتری های گرم منفی در دو سویه از طیور تجاری لاین آرین و بومی آذربایجان غربی بررسی و بیان آن در برخی از اندام های اصلی مطالعه شد. از 120 قطعه پرنده خون گیری و DNA کل آنها استخراج شد. با طراحی چهار جفت آغازگر اختصاصی، کل ژن TLR4 در چهار قطعه از پرندگان هر سویه توالی یابی شد. تاثیرات تغییرات اسیدآمینه ای بر عملکرد پروتیین با نرم افزار PANTHER بررسی شد. بررسی بیان ژن با روش RT-PCR نیمهکمی پس از استخراج RNA از بافت های کبد، طحال، و ریه انجام گرفت و سپس تصاویر حاصل از الکتروفورز با نرم افزار JImage پردازش و داده های حاصل از آن با نرم افزار آماری MINITAB تجزیه شد. نتایج تحقیق حاضر، سه SNP جدید T1147C)، A1832G، و (C2246A را نشان داد. بررسی های عملکرد پروتیینی نشان داد که همه این تغییرات تک نوکلیوتیدی در پروتیین مزبور اختلال ایجاد می کنند. بیان ژن TLR4 در سویه آرین مقادیر بالاتری را در مقایسه با سویه بومی نشان داد ولی دو سویه تفاوت معنی داری با هم نداشتند. باتوجه به اهمیت بالای این ژن در سیستم ایمنی ذاتی و مشخص شدن تغییرات نوکلیوتیدی جدید موثر بر ساختار پروتیین حاصل، این ژن می تواند به عنوان کاندیدی مرتبط با مقاومت ژنتیکی در جمعیت پرندگان مدنظر قرار بگیرد.

کلیدواژه ها:

بیان ژن ، چندشکلی تک نوکلیوتیدی ، ژن TLR4 ، ساختار پروتیین ، مرغ