ارایه یک چارچوب جدید مبتنی بر آنتولوژی ژن در روش خوشه بندی همپوشان برای داده های بیان ژنی
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: سومین کنفرانس ملی محاسبات توزیعی و پردازش داده های بزرگ
- کد COI اختصاصی: DCBDP03_034
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 639
نویسندگان
استادیار گروه مهندسی کامپیوتر، دانشکده فنی و مهندسی گلپایگان، اصفهان
چکیده
یکی از محدودیتهای روشهای سنتی برای خوشهبندی دادههای بیان ژن، یافتن خوشههای مجزا است که هدف نهایی اغلب این الگوریتمها میباشد. در حالیکه خوشههای همپوشان با دقت بالا در درک تعاملات صحیح مابین ژنها و یافتن شبکههای ژنی قابل اطمینان نقش مهم و بسزایی دارند، در این مقاله الگوریتم OverDBC ، که یک روش خوشهبندی مبتنی بر چگالی جدید برای مدلسازیخوشههای همپوشان است، با مفهوم آنتولوژی ژن توسعه داده می شود. این الگوریتم لیستهایی از ژنهای مشابه را با درنظرگرفتن سطوح بیان آنها ایجاد میکند که این امر ممکن است لزوما دانش قبلی را منعکس نکند. بنابراین نیاز به تمرکز بر روی روشهایی استکه اطلاعات تشابه بدست آمده از آنتولوژی ژن را برای پشتیبانی تحلیل بیان ژن مبتنی برخوشهبندی، تجمیع کند. با ترکیب دانش آنتولوژی ژن و دادههای همبستگی بیان ژن برای این روش خوشهبندی، می توان ناسازگاریها را به حداقل رساند و نزدیکترین نقاطرا در یک خوشه قرار داد. نتایج ارزیابی خوشه ها و همچنین شبکه های ژنی استخراج شده نشان می دهد که ترکیب اطلاعات آنتولوژی ژن با پارامتر فاصله ساختاری، منجر به بهبود نتایج خوشههای همپوشان میشود.کلیدواژه ها
خوشه های همپوشان،داده های بیان ژن،شبکههای ژنی، آنتولوژی ژنمقالات مرتبط جدید
- بررسی اجمالی اینترنت اشیاء و مشکلات امنیتی آن
- نقش فرماندهی و کنترل و سامانه های آن در نبرد های آینده
- نقش فناوری های بدون سرنشین در عملیات جنگ نوین
- نقش زیرساخت های نظامی سایبری در کنترل میدان جنگ (اقدامات الکترومغناطیسی سایبری)
- طراحی و شبیه سازی دروازه منطقی تمام نوری AND مبتنی بر بلور فوتونی با ابعاد کم و مناسب برای مدارهای مجتمع نوری
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.