تعیین هویت مولکولی و شجره شناسی بر اساس ژن نوکلیوکپسید ویروس برونشیت عفونی پرندگان جدا شده از گله های گوشتی در سا لهای 1393-1394

زمینه مطالعه: برونشیت عفونی یک بیماری مهم از نظر اقتصادی در ماکیان بوده که به دلیل ظهور ژنوتی پهای جدید ویروس برونشیت عفونی، کنترل این بیماری بعنوان یک مشکل جدی در صنعت طیور در دنیا مطرح است و پیش از این، مطالعه جامعی برروری این ژن بر رویژنوتی پهای سا لهای اخیر مختلف کشور انجام نگردیده بود. هدف: لزوم از انجام این مطالعه تعیین هویت مولکولی و شجره شناسی بر اساس ژن نوکلیوکپسید ویروس برونشیت عفونی جدا شده از گل ههای گوشتی ایران در سا لهای 1393 - 1394 م یباشد. روش کار : در این بررسی ژن نوکلیوکپسید ده جدایه از چهار نوع ژنوتیپ متفاوت ویروس برونشیت عفونی با استفاده از پرایمرهای اختصاصی تکثیر و با نرم افزا رهای مناسب شجره شناسی و تعیین ساختار مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. نتایج : از نظر شجره شناسی ویرو سهای برونشیت عفونی گروه ماساچوست، QX وB/793 در گروه خود قرار گرفتند و ژنوتیپ ویروس واریانت 2 در کنار سایر ویرو سهای جدا شده از ایران قرار داشتند. در صد تشابه بر اساس اسید آمینه، بین سوی ههای مختلف مورد مطالعه بین 97 / 89 تا 75 / 99 ٪ تشابه وجود داشت. بیشترین تشابه بین دو ژنوتیپ 1-IBKG و 8-IBKG موردمطالعه در گروه B/793 و کمترین تشابه بین دو ژنوتیپ QX و واریانت 2 )ویرو سهای 5-IBKG و 9-IBKG ( بوده، که این میزان تفاوت برای ژن نوکلیوکپسید )محافظت شده( نسبتا بالا م یباشد. بررسی بیوانفورماتیک نشان داد که پروتیین در این ویرو سها بین 6 تا 7 صفحه بتا و بین 8تا 10 مارپیچ آلفا دارند. نتیج هگیر ینهایی: نتایج حاصل از این مطالعه م یتواند اطلاعات مناسبی در زمینه استفاده از اطلاعات این پروتیین در تولید پروتیینهای نو ترکیب جهت تولید کی تهای الایزا و رو شهای تشخیص سریع، واکس نهای نو ترکیب و همچنین اپیدمیولوژی مولکولی این بیماری ویروسی مهم در کشور نماید.

کلیدواژه ها:

نوکلیوکپسید ، ویروس برونشیت عفونی پرندگان ، تعیین هویت مولکولی ، شجره شناسی