CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

ارایه روشی برای بازسازی شبکه ی عملکرد ژنی مبتنی بر دسته بند تک کلاسه با استفاده از زنجیره اسیدآمینه ی پروتیین ها

عنوان مقاله: ارایه روشی برای بازسازی شبکه ی عملکرد ژنی مبتنی بر دسته بند تک کلاسه با استفاده از زنجیره اسیدآمینه ی پروتیین ها
شناسه (COI) مقاله: IPRIA03_046
منتشر شده در سومین کنفرانس بین المللی بازشناسی الگو و تحلیل تصویر ایران در سال 1396
مشخصات نویسندگان مقاله:

علی جلیلوند - دانشجوی دکترا، دانشگاه تربیت مدرس
بهزاد اکبری نودوزقی - استادیار گروه نرم افزار، دانشگاه تربیت مدرس
فاطمه زارع میرک آباد - استادیار گروه علوم کامپیوتر، دانشگاه صنعتی امیرکبیر
باباعلی صفری - دانشجوی کارشناسی ارشد، دانشگاه تربیت مدرس

خلاصه مقاله:
بررسی پژوهش های که در سال های اخیر بروی تحلیل شبکه های زیستی ارایه شده می توان به اهمیت نقش این شبکه ها در فهم عملکرد سلولی پی برد. بنابراین حوزه جدیدی در بیوانفورماتیک با عنوان زیست سامانه ها )شبکه های زیستی) بوجود آمده است، کهروابط بین اجزا سلول را ازنقطه نظرهای مختلف بررسی می کنند. با توجه به ماهیت شبکه ی عملکرد ژنی، استفاده از این شبکه ها دراولویت بندی ژن های بیماری یا طراحی دارو نسبت به شبکه های زیستی دیگر کارایی بیشتری دارد. اما در بازسازی و مدلسازی اینشبکه ها با چالش های نظیر نامطمین بودن منابع زیستی اولیه ی مختلف، نا متقارن بودن داده های مثبت و منفی اشاره کرد. با توجه بهکاربردها و چالش های که بیان شد، در این پژوهش روشی مبتنی بر رویکرد دسته بندی تک کلاسه با استفاده از ساختار اول پروتیینبه عنوان یک داده ی مطمین اولیه برای پیش بینی یال ها و مدلسازی یک شبکه عملکرد ژنی مطمین ارایه شده است. همچنین برایاستخراج ویژگی از رویکرد آماری خودهمبستگی استفاده شده است. در نهایت به منظور ساخت و ارزیابی شبکه از ارتباطاتهستی شناسی ژن (به عنوان داده استاندارد) استفاده شده است. این روش بروی مجموعه داده مخمر آزمایش شده است که به ترتیب بهدقت 91 و 92 2 درصد دست یافته ایم.

کلمات کلیدی:
شبکه های ارتباط عملکردی، دسته بند تک کلاسه، پیش بینی لینک، شبکه ی هستی شناسی ژن

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/638497/