بررسی تغییرات اسید آمینه های سیتوکروم b و c در زیرگونه های ( Mus musculus ) و کاربرد آن ها در فیلوژنی

  • سال انتشار: 1395
  • محل انتشار: ششمین همایش سراسری کشاورزی و منابع طبیعی پایدار
  • کد COI اختصاصی: NACONF06_152
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 423
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

فرید فیضی باقل آباد

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوسیستماتیک جانوری، گروه علوم جانوری، دانشکده علوم زیستی،دانشگاه شهید بهشتی تهران

حسن رجبی مهام

استاد گروه علوم جانوری، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه شهید بهشتی تهران

چکیده

در این پژوهش از90 توالی سیتوکروم b و 90 توالی سیتوکروم c، mtDNA استفاده شد. توالی های مورد نظر مربوط به کمپلکس موش خانگی از بانک ژنی NCBI1 دریافت شدند. این توالی ها مربوط به سه زیرگونه موش خانگی هستند( Mus .(musculus musculus ,Mus musculus domesticus ,Mus musculus castaneus سپس توالی های نوکلیوتیدی هر زیرگونه توسط نرم افزارهای Mega.6 و Arlequin و dnaSP آنالیز شدند. هدف از این پژوهش بررسی تغییرات اسید آمینه های موجود در سیتوکروم های b وc زیرگونه های موش خانگی و کاربرد آن ها در فیلوژنی است. این بررسی تغییرپذیرترین اسید آمینه ها را به ما نشان می دهد و همچنین بیشترین اسید آمینه هایی که تمایل به تشکیل دارند نیز شناسایی شدند. میزان تفاوت های ژنتیکی هرکدام از زیرگونه ها مشخص و با یکدیگر مقایسه گردید، و میتواند بعنوان شاخص تمایز زیرگونه ها از یکدیگر مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه ها

اسید آمینه، توالی ، فواصل ژنتیکی ،cytochrome b ، cytochrome c

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.