بررسی انحراف کدونی توالی کد کننده ژن کالپاستاتین در برخی از پستانداران
- سال انتشار: 1395
- محل انتشار: ششمین همایش سراسری کشاورزی و منابع طبیعی پایدار
- کد COI اختصاصی: NACONF06_116
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 854
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح دام دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
هییت علمی دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
هییت علمی دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
هییت علمی پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان
چکیده
کالپاستاتین یکی از آنزیم های تشکیل دهنده سیستم پروتیولیتیک کال پاین ا ست که در شکل گیری، تجزیه بافت های عضلانی و تردیگوشت پس از ک شتار موثر بوده و به عنوان یک ژن کاندیدا درارتباط با راندمان رشد و کیفیت گو شت در دام های اهلی موردتوجه قرار گرفته است. در ا ین پژوهش توالی ناحیه کد کننده ژن کالپاستاتین در شش گونه پستاندار (انسان، موش، گاو، کژگاو، گوسفند و بز) مورد بررسی قرار گرفت. توالیهای ژنی و پروتیینی از با نک ژن بازیابی و مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. آنالیز همولوژی و همترازی، فیلوژنی، تنوعنوکلیوتیدی همچنین بررسی تنوع در طول ناحیه کدکننده وتنوع در کدون پایانی با استفاده از نرم افزارهای &OXVWDO وMega7انجام گرفت. با استفاده از نرم افزار CodonW شاخص های ترجیح کدونی محاسبه گرد ید تا وضعیت کارکرد کدونی توالی ها نمایان گردد. شاخص سازگاری کدون (CAI) در گونه گاو بالاترین مقدار( 256، 0)و در گونه گوسفند کمترین مقدار(236، 0)برآورد شد. شاخص گرایش کدونهای مترادف (RSCU) برای آمینواسیدهای سرین و آسپارتیک ا سید که به ع نوان ا سید آمی نه انتهایی در گونه های مختلف بوده اند به ترتیب (AGC 1/38) و (GAU 1/01) محاسبه گردید. همچنین گونه بز در شاخص تعداد کدونهای موثر (ENC) دارای بیشترین مقدار، میباشد.کلیدواژه ها
کالپاستاتین، آنالیز بیوانفورماتیکی، گرایش کدونی، آنالیز فیزیکیمقالات مرتبط جدید
- استفاده از مواد معدنی ریزمغذی در تغذیه جوجه های گوشتی
- تاثیر مکملهای آمینواسیدی بر عملکرد رشد در جوجه های گوشتی
- تاثیر پروبیوتیکها بر میکروبیوم روده جوجه های گوشتی و عملکرد آنها
- گردشگری و چالشهای آن در استان گیلان مطالعه موردی: شهرستان تالش
- برنامه ریزی راهبردی توسعه گردشگری با استفاده از آزمون swot مطالعه موردی شهرستان تالش
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.