ارزیابی گوناگونی ژنتیکی ژنوتیپ های انار (Punica granatum) طارم زنجان با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 513

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JHS-44-1_010

تاریخ نمایه سازی: 9 اسفند 1395

چکیده مقاله:

انار یکی از مهمترین میوه هایی است که ایران مرکز و کشت و کار آن در دنیا بشمار می رود و غنی ترین ذخایر ژنتیکی انار دنیا در ایران وجود دارد. در این مطالعه تنوع ژنتیکی 15 نمونه انار مربوط به شهرستان طارم زنجان با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD مورد بررسی قرار گرفت. DNA ژنومی از برگ ها استخراج، و از نظر ویژگی های کمی و کیفی در واکنش PCR، مورد ارزیابی قرار گرفتند. از تعداد 39 آغازگر تصادفی 10 نوکلئوتیدی، در مجموع 273 نوار تشکیل شد، 201 نوار چند شکل و 72 نوار تک شکل بودند. تعیین فواصل ژنوتیپ ها با استفاده از نرم افزار NTSYS انجام شد و در نهایت دندروگرام براساس ضریب تشابه SMC و الگوریتم UPGMA ترسیم گردید. بیشترین و کمترین تشابه بین ژنوتیپ ها به ترتیب برابر 80% و 59% بدست آمد. دندروگرام حاصل در حد تشابه 0/59 ژنوتیپ ها را به دو گروه جدا تقسیم کرد و در حد تشابه 0/63 ارقام به سه گروه تقسیم شدند. همچنین ضریب کوفنتیک بین ماتریس تشابه و دندروگرام حاصل در حد r=0/76 بدست آمد که نشان دهنده همبستگی مناسب دندروگرام با ماتریس تشابه است. در نمونه شیرین پوست نازک که در یک گروه جداگانه قرار گرفت امکان بهره گرفتن از هتروزیس و زمینه تولید واریته های هیبرید وجود دارد. گروه بندی بر اساس تجزیه به مولفه های اصلی نتایج حاصل از تجزیه کلاستر را تایید می کند.

نویسندگان

ولی ربیعی

استادیار ، مربی، دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان

مینا سعادتی

دانشجویان کارشناسی ارشد ، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

سجاد جعفری

استادیار ، مربی، دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان

سمیه محمدی

استادیار ، مربی، دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان