مطالعه ی بیوانفورماتیکی میانکنش آنزیم رنیلا لوسیفراز با سوبستراهای مختلف

آنزیم رنیلا لوسیفراز یک آنزیم تک زیر واحدی با وزن مولکوول 36 کیلودالتون است. این آنزیم طی واکنش با پیش ماده کوالنترازین و اکسید کردن آن سبب برانگیخته شدن کوالنترازین و تولید حد واسط واکنش به نام هیدرو پراکسی کوالنترازین شده است که در بازگشت به حال پایه تولید نوری با اول موج حدود 480 تا 540 نانومتر می کند. این آنزیم به دلیل توانایی تولید نور کاربردهای وسیع به عنوان کاوشگرهای زیستی در بیوتکنولوژی و تشخیص های مولکولی دارد. از آنجای که خاصی نشر نور کوالنترازین سبب ویژگی نور افشانی این آنزیم شده است پایداری ، طول موج و شدت نور نشری به میزان زیادی بستگی به ترکیب و نوع گروه های عامل درگیر در واکنش با آنزیم دارد، ببنابراین انواعی از آنالوگ های این ترکیب که به طور طبیعی در موجودات نور افشان وجود دارد طراحی و تولید شده اند. در این پژوهش با استفاده از داکینگ مولکولی توسط نرم افزار MVD تمایل اتصال و کانفورماسیون دو نوع دیگر از آنالوگ کوالنترازین ( بیس دزوکسی کوالنترازین و کوالنترازین- V) مورد بررسی قرار گرفت. بررسی های انجام گرفته نشان می دهد اتصال و میانکنش آنزیم با سوبسترای کوالنترازین مناسب تر از دو سوبسترای دیگر می باشد.

کلیدواژه ها:

رنیلا لوسیفراز ، کوالنترازین ، داکینگ مولکولی