A New Hybrid Evolutionary Biclustring Algorithm Based on Transposed Virtual Error

  • سال انتشار: 1394
  • محل انتشار: دومین کنفرانس بین المللی مهندسی دانش بنیان و نوآوری
  • کد COI اختصاصی: KBEI02_045
  • زبان مقاله: انگلیسی
  • تعداد مشاهده: 577
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

Sina Mahmoudi

Department of Electrical, Computer and IT Engineering, Qazvin Branch, Islamic Azad University, Qazvin, Iran

Mohammad Bagher Menhaj

Professor of Electrical Engineering, Amirkabir University of Technology, Tehran, Iran

چکیده

Microarray technology in the last decade has been widely applied to detect correlated biomarkers in biological processes. Due to the need for analyzing massive amounts of generated data in this technology, computational intelligence approaches are used increasingly in this field. Biclustering algorithms are one of the most important of these techniques in microarray analysis. Two aspects of search mechanisms and biologists’ desired patterns are the most essential issues in the design and evaluation of these algorithms. Different patterns can be achieved by considering different metrics. In this paper, Transposed Virtual Error (VET) is used as main metric. Also a hybrid evolutionary algorithm is proposed based on Evo-Bexpa algorithm which is introduced with VET. The proposed method is developed based on Genetic Algorithm (GA) used in Evo-Bexpa and Asexual Reproduction Optimization (ARO). The results indicate that underlying algorithm against Evo-Bexpa is more efficient in finding biclusters

کلیدواژه ها

miroarray; evolutionary algorithm; biclustering; transposed virtual error; bioinformatics

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.