ارزیابی فیلوژنتیکی ژن کیموزین گاوی در قارچ رایزوموکور میهی و برخی پستانداران

  • سال انتشار: 1395
  • محل انتشار: سومین کنگره سراسری در مسیر توسعه علوم کشاورزی و منابع طبیعی
  • کد COI اختصاصی: ICDAN03_052
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 784
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

سهیلا محب زاده

دانشجوی کارشناسی ارشد رشته مهندسی بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیلی

ناصر زارع

دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیلی

رسول اصغری زکریا

دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیلی

بهرام فتحی آچاچلوئی

دانشیار گروه صنایع غذایی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیلی

چکیده

رنین عامل مهمی در فرآیند تولید پنیر بوده و شامل پروتئینازهای اسید آسپارتیک، کیموزین و پپسین میباشد که با اثر هیدرولیتیک بر پیوند پپتیدی میان اسید آمینههای شماره Phe106-Met105 کاپاکازئین، باعث تشکیل لخته شیر میشود آنزیم کیموزین به طور عمده در صنایع غذایی استفاده میگردد. در این پژوهش، توالی ژن کیموزین شش گونهمختلف از پستانداران و قارچ رایزوموکور میهی مورد بررسی قرار گرفت. ارزیابیهای هم ترازی، فیلوژنتیکی و تنوع ژنتیکی در ناحیه کدکننده با استفاده از نرمافزارهای بیوانفورماتیکی انجام شد. میزان تنوع نوکلئوتیدی برای هر جایگاه 398/0 و متوسط تفاوتهای نوکلئوتیدی (K (در گونهها 809/274 بدست آمد. مطالعات همترازی و فیلوژنتیکی توالیهای کامل و نیز توالیهای کدکننده نشان داد که ژن کیموزین رایزوموکور میهی مطابقت کمی با توالی آن در پستانداران مورد مطالعه داشته است و از نظر فیلوژنتیک نیز در گروه مجزایی نسبت به گونههای پستاندار قرار دارد. از نظر نواحی حفاظت شده نیز تفاوتهای قابل توجهی بین ژن کیموزین رایزوموکور میهی و برخی گونههای پستانداران مشاهده گردید. بنابراین با توجه به نقش مهم این ژن در صنایع غذایی بویژه تولید پنیر، نتایج این پژوهش میتواند به منظور مطالعات مولکولی دقیقتر در راستای مدیریت منابع ژنی، مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه ها

فیلوژنیک مولکولی، ژن کیموزین، بیوانفورماتیک، آنزیم لختهکننده شیر

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.