طراحی الگوریتمی جهت استخراج ORF ها درژنوم های پروکاریوتی
- سال انتشار: 1385
- محل انتشار: چهاردهمین کنفرانس مهندسی برق ایران
- کد COI اختصاصی: ICEE14_015
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 1202
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان – دانشکده پزشکی - گر
استادیار دانشگاه علوم پزشکی اصفهان
دانشجوی دکترای بیوانفورماتیک ( Tuebingen)
چکیده
این الگوریتم پس از استخراج تمام orf های موجود. Orf های غیر همپوشان طولانی تر از یک سطح آستانه را که توسط کاربر تعیین می شود، را از بین orf های استخراج شد ه ، جدا میکند . الگوریتم پیشنهادی را به زبا ن ++C کدکرده و سپس آنرا بر روی ژنوم Ecoli آزمایش نموده و نتیجه با نرم افزار Glimmer مقایسه شده است و مشاهده شدکه روش ارائه شده در یافتن orf های بلندغیر همپ وشان دارای دقت بیشتری نسبت به Glimmer است . در آزمایش دیگر ازاطلاعات ارائه شده در GenBank استفاده شد و مشاهده شد که نزدیک به 90 درصد از orf های بلند غیر همپوشان بدست آمده ژن هستند. ازکاربردهای عمده این طرح یافتن orf ها بعنوان نامزدهای اولیه ژن و همچنین گرد آ وری اطلاعات لازم برای تعلیم الگوریتمهای یادگیری ماشینی به صورت خودآموز جهت انتخاب دقیق موقعیت ژنها است.کلیدواژه ها
قالب خواندنی باز (orf)، قالب خواندنی (Prokaryotic gene prediction ،Gene overlapping ،(rfمقالات مرتبط جدید
- تاثیر نوروفیدبک بر آموزش کودکان مبتلا به ADHD و اختلالات خواندن: یک بررسی سیستماتیک
- بررسی نقش سیستم های پیشرانش جت و بهبود کارایی انتقال حرارت در انجین های فضاپیما
- مروری بر کاربرد داده کاوی در کشف دانش پنهان
- تجزیه و تحلیل ترمودینامیکی استفاده از یک چرخه دی اکسید کربن فوق بحرانی با اینترکولر، گرم کردن مجدد و احیاکننده برای بازیابی گرمای اتلافی یک توربین گازی
- کاربرد IOT در مهندس پزشکی
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.