PCR-SSCP: A method to fingerprint sequence variability in plant gene pools using the Iranian wild diploid Triticum

  • سال انتشار: 1393
  • محل انتشار: مجله سلول و تحقیقات مولکولی، دوره: 6، شماره: 1
  • کد COI اختصاصی: JR_JCMR-6-1_005
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 527
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

fatemeh Nasernakhaei

Department of Biology, Faculty of Sciences, University of Isfahan, Isfahan, Iran

Mohammad Reza Rahiminejad

Department of Biology, Faculty of Sciences, University of Isfahan, Isfahan, Iran

Hojjatollah Saeidi

Department of Biology, Faculty of Sciences, University of Isfahan, Isfahan, Iran

Manoochehr Tavassoli

Department of Biology, Faculty of Sciences, University of Isfahan, Isfahan, Iran

چکیده

As a case study, the genotypic polymorphism of the Iranian material of diploid Triticum was screened based on internal transcribed spacer 2 (ITS2) of the ribosomal DNA (rDNA) using single strand conformation polymorphism (SSCP) analysis. This is a simple and cost effective technique for genotyping and investigating the allelic polymorphism among plant populations. Performing SSCP analysis among 21 accessions, two distinctive migration profiles associated with the two validly recognized diploid Triticum species i.e., T. monococcum subsp. aegilopoides and T. urartu were detected. Nucleotide sequencing confirmed the distinction of two types of observed profiles. This study suggested that SSCP is an applicable diagnostic molecular tool for screening the genotypic variability before the costly direct genomic sequencing is begun

کلیدواژه ها

diploid, Iran, ITS2, SSCP, Triticum

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.