برهمکنش تاکاآمیلاز مهندسی شده وحشی و انواع کوتاه شده ان باقندهای هشت تا ده زیرواحدی مالتوز : مطالعه داکینگ

  • سال انتشار: 1395
  • محل انتشار: سومین کنفرانس بین المللی دستاوردهای نوین پژوهشی در شیمی و مهندسی شیمی
  • کد COI اختصاصی: CHECONF03_016
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 682
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

محمد اسلامی

گروه بیوشیمی واحدعلوم پایه دانشگاه آزاد اسلامی دامغان ایران

محمدرضا بزرگمهر

گروه شیمی واحدعلوم پایه دانشگاه آزاد اسلامی دامغان ایران

حمید هاشمی مقدم

گروه شیمی واحدعلوم پایه دانشگاه آزاد اسلامی دامغان ایران

چکیده

امروزه با گسترش تحقیقات بنیادی کاربرد تحقیقات در بستر این سیلیکو اهمیت بیشتری یافته است در این پژوهش با مهندسی انزیم در این سیلیکو به ترتیب 50 و 100 آمینه از –c به ترتیب برای تولید آمیل S1- امیل –S2 حذف شدند. برهمکنش ساختار وحشی آمیل C- و کوتاه شده تاکا آمیلاز با الیگوساکاریدهای هشت تا ده زیرواحدی مالتوز به وسیله برنامه های پرکاربرد در این زمینه بررسی شد که شامل اتوداک وینا و لیگپلات اسیدهای امینه هیدروفیل در جایگاه اتصال انزیم لیگاند نقش موثری دراند به همین خاطر با استفاده ازنرم افزار تحت وب پرات اسکیل از طریق بانک اطلاعت اکسپسی توالی آمیل C- از لحاظ هدیروفبیسته و هیدروفیلیسیته بررسی گردید سپس برا این منظور نتایج هر سه آنزیم توسط برنامه لیگپلات تعیین و با مقایسه امتیاز هیدروپاتی امینواسیدهای حاضر در جایگاه اتصال لیگاند با آنزیمهای با این تیجه استنباط شد که هرچه لیگاند طولتر می شود محلهای اتصال آن بر روی آنزیم هیدروفوب تر می گردد اگرچه آمیل SI نسبت به آمیل C و آمیل S2 با اتلاف یک واحدهای تمایل بیشتری به اتصال با مالتوهکتالوز دارد. با افزایش تعداد حلقه های گلوکزی لیگاند و حذف انتهای C ترمینال آنزیمهای مورد نظر اینگونه استنباط می گردد که محل اتصال آمیلازها با لیگاندهای طویل تر تحت تاثیر انتهای C ترمینال نیست.

کلیدواژه ها

آمیلاز، قند، داکینگ، مهندسی پروتئین، اتوداک وینا

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.