ارائه یک روش انتخاب ویژگی-نگاشت برای دسته بندی داده های اومیکس

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 683

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

ICTCK02_043

تاریخ نمایه سازی: 8 آبان 1395

چکیده مقاله:

تکنولوژی های اومیکس شامل ژنومیکس، ترانسکریپتومیکس، پروتئومیکس و متابولومیکس می باشد. مطالعاتاومیکس مقدار داده های عظیمی ایجاد می کنند که این داده ها ابعاد زیادی دارند در نتیجه انتخاب ویژگی نقش مهمیدر پیدا کردن ویژگی های مفید از این داده ها خواهد داشت. هدف این تحقیق یافتن ویژگی های بهینه از طریق ادغامروشهای انتخاب ویژگی و همچنین ساخت مدلی است که بتواند با صحت بالاتری نمونه های مختلف را متمایز کند. بههمین منظور، ما 2 روش انتخاب ویژگی را در حالت های مختلف به کار برده ایم که این روشها شامل دو متد رتبه بندیکی دو و سودمندی اطلاعات که وابستگی ویژگی را به کلاس نشان می دهند، می باشد. سپس برای دسته بندی از الگوریتمKOPLS-DA با کرنل خطی که مبتنی بر متغیرهای پنهان است، استفاده شده است. نتایج بدست آمده بر روی 3 منبع داده که مربوط به دو نوع سرطان ملانوما و ریه می باشد به این صورت است: صحت الگوریتم دسته بندی کننده را درحالتی که دو روش انتخاب ویژگی با هم ادغام شده اند با معیار0.88DQ2 بدست آوردیم که در مقایسه با کار مشابه دیگری که به صحت 0.723 دست یافته ، عملکرد بهتری داشته است.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

آیدا صباغ مقدم

دانشگاه آزاد اسلامی واحد مشهد

محمدحسین معطر

دانشگاه آزاد اسلامی واحد مشهد

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • ]1[R. P. Horgan and L. C. Kenny, _ transcriptomic _ ...
  • Obstetrician & Gynaecologist, vol. 13, pp. 189-195, 2011. ...
  • ]1[O. A. Jones, Metabolomics and systems biology in human health ...
  • J9[S. Wold, M. Sjostrom, and L. Eriksson, of ...
  • chemometrics, 2 Chemometrics and intelligent laboratory systems, vol. 58, pp. ...
  • ]9[J. Trygg and S. Wold, "Orthogonal projections to latent structures ...
  • ]5[M. Rantalainen, M. Bylesjo, O. Cloarec, J. K. Nicholson, E. ...
  • Chemometrics, vol. 21, pp. 3.1117 , 985--76 ...
  • J6[S. Roussel, V. B ellon-Maurel, J.-M. Roger, and P. Grenier, ...
  • ]7[A. K. Smilde, M. J. van der Werf, S. Bilsma, ...
  • chemistry, vol. 77, pp. 6729-6736, 2005. ...
  • ]8[J. Boccard and D. N. Rutledge, "A consensus orthogonal partial ...
  • ]3[S. Agnieszka, B. Lionel, C. Leon, A. M. A. Kirsten, ...
  • ]1[Q. Gu, Z. Li, and J. Han, "Generalized fisher score ...
  • ]11[I. Guyon and A. Elisseeff, "An introduction to variable and ...
  • ]11[Z. Zhao , F. Morstatter, S. Sharma, S. Alelyani, A. ...
  • Nicholson, E. Holmes, and J. Trygg, "K- OPLS package: Kernel-based ...
  • ]19[J. M .Fonville, M. Bylesjo, M. Coen, J. K. Nicholson, ...
  • orthogonal projections to latent structures optimized by simulated annealing, " ...
  • ]15[R. H. Shoemaker, "The NCI60 human tumour cell line anticancer ...
  • ]16[J. Westerhuis, E. J. van Velzen, H. J. Hoefsloot, and ...
  • نمایش کامل مراجع