آنالیز بیوانفورماتیکی و ژنتیکیHSP 70در بین حیوانات مزرعه ای
- سال انتشار: 1394
- محل انتشار: دومین کنفرانس بین المللی توسعه پایدار، راهکارها و چالش ها با محوریت کشاورزی ، منابع طبیعی، محیط زیست و گردشگری
- کد COI اختصاصی: ICSDA02_287
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 1128
نویسندگان
دانشجوی ارشد ژنتیکو اصلاح دام دانشگاه محقق اردبیلی
استادیار گروه علوم دامی- دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیل
استادیار گروه علوم دامی- دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیل
استادیار گروه علوم دامی- دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیل
چکیده
تاثیر مقاومت سلولی به استرس به وسیله خانواده ای از پروتئین ها که اصطلاحا پروتئین های شوک گرمایی نامیده می شودایجاد می شود. ژن های مسئول این پروتئین هادر زمان استرس های محیطی و پاتولوژیکی فعال می شوند. پروتئین شوک گرمایی (HSP70) 70یکی از مهمترین اعضای خانواده پروتئین های شوک گرمایی است که بر بسیاری از صفات تولیدی موثر است. هدف از این مطالعه شناسایی تفاوت نوکلئوتیدی بین گونهای می باشد. به این منظور تعداد 27 توالی از این ژن جهت بررسی شباهت ها و تفاوت های ژنتیکی بین گونه های حیوانات مزرعه ای استفاده شد. سپس با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی موردتجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج آنالیز تنوع ژنتیکی باعث شناسایی جهش هایی گردید که خود منجر به ایجاد 27 هاپلوتیپ با تنوع هاپلوتیپی 1.000 در گونه های مورد مطالعه شد. تنوع نوکلئوتیدی 0/02801 و میانگین تعداد تفاوت های نوکلئوتیدی K=52/85470 بود. آنالیز تنوع ژنتیکی نشان داد که خوک بیشترین تنوع را در مقایسه با دیگر گونه های مورد مطالعه در بین دام های اهلی دارد. همچنین بررسی فاصله ژنتیکی و تمایز ژنتیکی بین گونه ها نشان داد که در مقایسه با دیگر دام ها گونه گوسفند به گونه بز نزدیکتر است و گونه گاو و گاومیش جد مشترک نزدیک به هم دارند . باتوجه به تنوع بالای مشاهده شده ژنHSP 70 در آنالیزهای فیلوژنتیک می توان نتیجه گرفت که وجود تنوع بالا در این ژن می تواند دلیلی بر تفاوت مقاومت به استرس های محیطی در بین دامهای مزرعه باشدکلیدواژه ها
ژنHSP70 ، درخت فیلو ژنتیکی، هاپلوتیپ، تنوع ژنتیکیمقالات مرتبط جدید
- بررسی تنوع زیستی گیاهان مرتعی ارتفاعات کبیرکوه در جنوب دره شهر (استان ایلام)
- عوامل موثر بر میزان پیچان رودخانه های خرم اباد
- ارزیابی کیفیت آب شرب گاوهای شیری در گاوداری های صنعتی حومه مشهد از نظر وجود فلزات سنگین، نیترات و سولفات
- بیو پلیمر پلی ساکاریدی برای مصارف دامپزشکی
- راهکارهای کارآمد کاهش انتشار گازهای گلخانه ای از طریق فناوری کشاورزی هوشمند
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.