آنالیز بیوانفورماتیکی و ژنتیکیHSP 70در بین حیوانات مزرعه ای

تاثیر مقاومت سلولی به استرس به وسیله خانواده ای از پروتئین ها که اصطلاحا پروتئین های شوک گرمایی نامیده می شودایجاد می شود. ژن های مسئول این پروتئین هادر زمان استرس های محیطی و پاتولوژیکی فعال می شوند. پروتئین شوک گرمایی (HSP70) 70یکی از مهمترین اعضای خانواده پروتئین های شوک گرمایی است که بر بسیاری از صفات تولیدی موثر است. هدف از این مطالعه شناسایی تفاوت نوکلئوتیدی بین گونهای می باشد. به این منظور تعداد 27 توالی از این ژن جهت بررسی شباهت ها و تفاوت های ژنتیکی بین گونه های حیوانات مزرعه ای استفاده شد. سپس با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی موردتجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج آنالیز تنوع ژنتیکی باعث شناسایی جهش هایی گردید که خود منجر به ایجاد 27 هاپلوتیپ با تنوع هاپلوتیپی 1.000 در گونه های مورد مطالعه شد. تنوع نوکلئوتیدی 0/02801 و میانگین تعداد تفاوت های نوکلئوتیدی K=52/85470 بود. آنالیز تنوع ژنتیکی نشان داد که خوک بیشترین تنوع را در مقایسه با دیگر گونه های مورد مطالعه در بین دام های اهلی دارد. همچنین بررسی فاصله ژنتیکی و تمایز ژنتیکی بین گونه ها نشان داد که در مقایسه با دیگر دام ها گونه گوسفند به گونه بز نزدیکتر است و گونه گاو و گاومیش جد مشترک نزدیک به هم دارند . باتوجه به تنوع بالای مشاهده شده ژنHSP 70 در آنالیزهای فیلوژنتیک می توان نتیجه گرفت که وجود تنوع بالا در این ژن می تواند دلیلی بر تفاوت مقاومت به استرس های محیطی در بین دامهای مزرعه باشد

کلیدواژه ها:

ژنHSP70 ، درخت فیلو ژنتیکی ، هاپلوتیپ ، تنوع ژنتیکی