میلاد شکوهی نیا - کارشناسی ارشد،گروه زیست، دانشگاه ملی زابل، زابل، ایران
رویا بیت سیاح - کارشناسی ارشد،گروه زیست، دانشگاه ملی زابل، زابل، ایران
احمد راشکی - دانشیار، گروه زیست، دانشگاه ملی زابل، زابل، ایران

باکتری اشریشیاکلای به دلیل توانایی در کسب ژنها یا جزایر پاتوژنیسیته و در نتیجه ایجاد سویههای پاتوژن، یکی از مهمترین پاتوژن های انسانی به شمار می آید. از اینرو تشخیص دقیق این باکتری ضروری است. تکنیک PCR چندگانه بااقابلیت شناسایی همزمان چند توالی هدف، روشی قابل قبول در تشخیص این باکتری محسوب می شود. مهمترین مرحله در این تکنیک طراحی صحیح پرایمر می باشد. به منظور طراحی پرایمر مربوط به توالی پنج ژن neuS ، kpsII ، iutA ، ibeA و cdtB در باکتری اشریشیاکلای ، از نرم افزار MP primer استفاده گردید. سپس ویژگی های پرایمرهای طراحی شده از طریق نرم افزار Oligo Analyzer مورد بررسی قرار گرفت. در نهایت اختصاصیت پرایمرها با استفاده از نرم افزار Blast NCBI ارزیابی شد پس از بررسی اختصاصیت پرایمرها، به دلیل طراحی دقیق آنها، مشاهده شد که توالی هدف هر کدام از جفت پرایمرها، تنها در سویه های باکتری اشریشیاکلای وجود دارد. از این رو پرایمر های طراحی شده در این پژوهش، برای شناسایی این باکتری بسیار مناسب می باشد.

اشریشیاکلای، پرایمر، MP primer ، Oligo Analyzer ، Blast NCBI