بررسی اثر استفاده از درصد بالای حیوانات برتر نسل قبل به عنوان گروه پایه بر صحت ارزیابی ژنومیک گروه تایید در تراکم نشانگری بالا

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 502

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

DPCONF01_151

تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1394

چکیده مقاله:

ارزشهای اصلاحی ژنومیک (GEBV) با استفاده از تعداد زیادی از نشانگرهای SNP برای انتخاب ژنومیک مورد محاسبه قرار می گیرند. یک فاکتور کلیدی برای یک برنامه انتخاب ژنومیک موفق، توانایی برای پیش بینی دقیق GEBV می باشد. این امر نیاز به یک جامعه مرجع (گروه پایه) دارد که اثرات نشانگری به وسیله آن به طور صحیح تخمین زده شوند. در این تحقیق ما استفاده از اطلاعات 50-40 درصد از حیوانات برتر نسل قبل را (بر اساس ارزیابی ژنتیکی سنتی) نسبت به انتخاب 50-40 درصد از حیوانات همان نسل به طور تصادفی، مورد مقایسه قرار دادیم. در این مطالعه برای هر حیوان ژنومی متشکل از 3 کروموزوم هریک با 1000 نشانگر SNP که با فواصل مساوی از یکدیگر قرار گرفته بودند شبیه سازی شد. برای ایجاد میزان کافی عدم تعادل پیوستگی بین مکانهای ژنی، تلاقی تصادفی برای 50 نسل در یک جمعیت محدود انجام شد. در نسل 51 اندازه جمعیت به 3000 حیوان افزایش یافت و این ساختار تا نسل 55 ادامه یافت. حیوانات نسل 5 جوان، فاقد رکورد و کاندیدای انتخاب بودند. نتایج این مطالعه نشان داد به کار بردن حیوانات برتر منجر به کاهش صحت ارزیابی ژنومیک به میزان تقریبی 5 درصد می شود.

کلیدواژه ها:

جامعه مرجع ، کاندیدای انتخاب ، نشانگر ، حیوانات برتر و صحت ارزیابی ژنومیک

نویسندگان

آزاده بوستان

استادیار گروه علوم دامی اردبیل، دانشگاه محقق اردبیلی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی مغان، گروه علوم دامی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • (مهدی ساعتچی: برآورد ارزشهای اصلاحی با استفاده از اطلاعات نشانگرهای ...
  • Calus, M. P. L. et al. Accuracy of genomic selection ...
  • Daetwyler, H. D. et al. Accuracy of predicting the genetic ...
  • Dassonneville, R. et al. Inclusion of cow records in genomic ...
  • Goddard, M. Genomic selection: Prediction of accuracy and maximisation of ...
  • Ib aiez-Escriche, N. and Gonzalez-Re. io, O. Review. Promises, pitfalls ...
  • Lourenco, D. A. L. et al. Methods for genomic evaluation ...
  • Meuwissen, T. H. E., Hayes, B. J. and Goddard, M. ...
  • نمایش کامل مراجع