مقایسه عملکرد زبان برنامه نویسی C با FORTRAN برای مطابقت رشته های DNA با رابط موازی سازی OpenMP
- سال انتشار: 1394
- محل انتشار: کنفرانس بین المللی علوم مهندسی، هنر و حقوق
- کد COI اختصاصی: ICESAL01_167
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 1350
نویسندگان
دانشجو کارشناسی ارشد دانشگاه امام رضا(ع) - مشهد
استادیار دانشگاه فردوسی - مشهد
دانشجو کارشناسی ارشد دانشگاه امام رضا(ع) - مشهد
دانشجو کارشناسی ارشد دانشگاه امام رضا(ع) - مشهد
چکیده
در این مقاله سعی داریم, تا با استفاده از یک الگوریتم موازی به نام کامبت که زاتا یک الگوریتم سریال است را به نحوه که در ادامه به شرح آن می پردازیم، قسمتی های از الگوریتم را به صورت موازی با رابط موازی سازیOpenMP پیاده سازی کنیم, تا با استفاده از آن در سطح DNA پروتئین برای مطابقت رشته DNA در ناحیه کد , دو زبان برنامه نویسی FORTRAN و C را با رابط موازی سازی OpenMP مورد مقایسه قرار دهیم. اما هدف از ارائه این مقاله این است, که کدام یک زمان کمتری را برای مطابقت دو رشتهDNA ناحیه کد در سطح پروتئین ارائه می دهد.در حالی زمان اجرای برنامه در هر دو زبان با تعداد پردازنده ای متفاوت مورد بررسی قرار میگردند، تا در پایان این مقاله به هدف اصلی مورد نظرمان که، از کدام یک از این دو زبان در آزمایشات آینده برای مطابقت دو رشته DNA استفاده نماییم.کلیدواژه ها
زبان برنامه نویسیC / OpenMP , FORTRAN/مطابقت رشته DNAاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.