مقایسه بیوانفورماتیکی بین شاخص های ترجیح کدونی ژن های رمز کننده پمپ انتقال دهنده فلزات سنگین ( P1B-ATPase ) بین گیاهان و باکتری های مختلف
- سال انتشار: 1392
- محل انتشار: هشتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران و چهارمین همایش ملی امنیت زیستی
- کد COI اختصاصی: NBCI08_1015
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 492
نویسندگان
شیراز، دانشگاه شیراز، دانشکده کشاورزی، بخش زراعت و اصلاح نباتات
شیراز، دانشگاه شیراز، دانشکده کشاورزی، بخش زراعت و اصلاح نباتات
شیراز، دانشگاه شیراز، دانشکده کشاورزی، بخش زراعت و اصلاح نباتات
شیراز، دانشگاه شیراز، دانشکده کشاورزی، بخش زراعت و اصلاح نباتات
چکیده
به منظور بررسی و مقایسه شاخص های ترجیح کدونی ژن های رمز کننده پمپ انتقال دهنده فلزات سنگین(p1B-ATPase) در گیاهان و باکتری های مختلف توالی نوکلئوتیدی ژن های مزبور از بانک اطلاعاتی EBI گرفته شد و از نظر شاخص های ترجیح کدونی توسط سایت codonw 4.1 مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفته و باهم مقایسه شدند. نتایج نشان داد که اختلاف معنی دار ی در سطح 5% بین شاخص های T3 ، CAI ، CBI ، FOP ، ENc ، L-Sym و L-aa وجود دارد. به طور کلی شاخص های مانند CAI و FOP در باکتری ها بیشتر از گیاهان است که نشان دهنده میزان بیان بیشتر این ژن در باکتری ها هست. همچنین مشاهده شد که در گیاهان T و G دارای بیشترین فراوانی و در باکتری ها C و G دارای بیشترین فراوانی در کدون انتهایی هستند. تفاوت بین گیاهان و باکتری ها از نظر شاخص ENc نشان می دهد که باکتری ها دارای انحراف کدونی بیشتری نسبت به گیاهان هستند که می تواند ناشی از محتوای CG3 بیشتر آن ها باشد که دارای ضریب همبستگی مثبت تری نسبت به گیاهان می باشد.کلیدواژه ها
ترجیح کدونی، فلزات سنگین، گیاهان، باکتری هامقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.