بررسی بیوانفورماتیکی عملکرد ژن شبه دفنسین D2 در گیاه توت فرنگی
- سال انتشار: 1392
- محل انتشار: هشتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران و چهارمین همایش ملی امنیت زیستی
- کد COI اختصاصی: NBCI08_0728
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 679
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه کردستان
استادیار گروه بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی،دانشگاه کردستان
دانشجوی کارشناسی ارشد جنگلداری دانشکده منابع طبیعی،دانشگاه کردستان
چکیده
موجودات زنده شامل گیاهان معمولا در معرض پاتوژن های بیشماری در طبیعت قرار دارند.آنها در پاسخ به حمله پاتوژن ها یک سیستم ایمنی ذاتی تکاملی توسعه داده اند.دفنسین های گیاهی پپتیدهای کوچک،بسیار پایدار و غنی از سیستئین هستند که بخشی از سیستم ایمنی ذاتی،که عمدتا در برابر پاتوژن های قارچی شدیدا مقاوم هستند هدف از این تحقیق مقایسه پروموتر ژن دفنسین در گیاهان مختلف است تا امکان معرفی آن به عنوان پروموتری القاپذیر اختصاصی در مقابل بیمارگرها مورد بررسی قرار گیرد.بدین منظور با استفاده از بانک بیوانفورماتیکی فیتوزوم(PHYTOZOME)؛1500 نوکلئوتید بالادست ناحیه کد کننده ژن دفنسین توت فرنگی به عنوان پروموتر انتخاب شد.سپس توسط نرم افزار PLANTCARE مورد بررسی قرار گرفت .نتایج نشان داد که پروموتر ژن دفنسین در این گیاهان دارای عناصر اختصاصی پاسخ به هورمون های سالیسیلک اسید ،جاسمونیک اسید و دیگر عناصر پاسخ به زخم،خشکی،قارزچ،جیبرلین و اکسین است.با حضور پروموترهای القا پذیر ،ژن های پاسخ دهنده بیمارگر در زمان حمله بیمارگر پاسخ داده و بار متابولیکی اضافی در زمان غیاب تحمیل نخواهد شد.از طرفی با کاهش مصرف سموم شیمیایی بسیاری از هزینه های سم پاشی . آثار مخرب زیست محیطی این سموم کاهش خواهد یافت.کلیدواژه ها
بیوانفورماتیک،بررسی پرومتر،ژن های دفنسین،مقاومت به بیمارگراطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.