شناسایی، طبقه بندی و مطالعه فیلوژنتیکی اعضای خانواده ژنی عوامل رونویسی bZIP در گندم
سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 400
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0533
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
عوامل رونویسی خانواده ،bZIP فرآیندهای مهمی را ازجمله واکنش به تنش های زنده و غیرزنده کنترل می کنند. بنابراین شناسایی و مطالعه ی این خانواده ی ژنی در گیاهان زراعی مهمی همچون گندم گامی موثر در راستای یافتن راهکارهایی هدفمند برای اصلاح این گیاهان خواهد بود. جهت یافتن اعضاء خانواده ،bZIP در گندم ،(Triricum aestivum) جستجو در پایگاهای اطلاعاتی مرتبط از جمله NCBI، Embl،Trifull cds ،GrainGenes، Gramineae، plantTFDB انجام شد. در بانک اطلاعاتی NCBI، جستجو و همردیف سازی با استفاده از ابزار tBLASN بر علیه داده های نوکلئوئیدی گندم با استفاده از توالی های پروتئینی حفاظت شده ی هر زیر خانواده bZIP در گیاه آرابیدوپسیس تالیانا، ذرت و گندم صورت گرفت. در مجموع 97 عضو یافت شد و با استفاده از نرم افزار های ClustalW ،BioEdit و Mega4ٍ هم ردیفی توالی اعضا و رسم درخت فیلوژنیکی انجام گرفت. اعضای پیداشده به 11 گروه طبقه بندی شدند به طوری که 26 عضو در گروه A، ا3 عضو درگروه B، ا8 عضو در گروه C، ا22 عضو در گروه D، ا4 عضو در گروه E، ا2 عضو در گروه F، ا11 عضو درگروه G، ا6 عضو درگروه H، ا3 عضو درگروه I، ا10 عضو درگروه S و 2 عضو در گروه U قرار گرفتند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
زهرا سادات شبر
بخش بیوانفورماتیک، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران
صغری علوی
بخش بیوانفورماتیک، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :