بررسی خصوصیات یک پروتئین ناشناخته در گیاه برنج با استفاده از ابزارهای بیوآنفورماتیکی
- سال انتشار: 1392
- محل انتشار: هشتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران و چهارمین همایش ملی امنیت زیستی
- کد COI اختصاصی: NBCI08_0501
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 825
نویسندگان
دانشجوی دکترای بیوتکنولوژی کشاورزی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان
دانشجوی دکترای بیوتکنولوژی کشاورزی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان
استادیارگروه اصلاح نباتات وبیوتکنولوژی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
چکیده
بیوآنفورماتیک و روش های محاسباتی ابزاری موثر در مطالعه پروتئین می باشند. دراین مطالعه یک توالی پروتئینی ناشناخته ثبت شده به شماره دسترسی BAD81308.1 برای بررسی و مطالعه ساختار و عملکرد احتمالی مورد استفاده قرار گرفت. پس از BLAST توالی مورد نظر برعلیه دیتابیس پروتئین غیرتکراری و مقایسه تعدادی از توالی های استخراج شده دارای همولوژی بالابا این پروتئین، تعدادی از دامینها و موتیف های مهم موجود در این پروتئین شناسایی شدند. پروتئین مورد مطالعه به طور اختصاصی باگروهی از پروتئین های باند شونده به DNA تحت عنوان RPA1-DBD-Like همولوژی نشان داد. نتیجه این همولوژی شناسایی دو دمین A و B ازاین پروتئین برروی توالی مذکور بود.کلیدواژه ها
بیوآنفورماتیک، پایگاه داده پروتئین، سطح باند شونده، دومینمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.