بررسی بیوانفورماتیکی ژن بتاآمیرین سنتازدرخانواده آستراسه و چندین خانواده گیاهی
- سال انتشار: 1392
- محل انتشار: هشتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران و چهارمین همایش ملی امنیت زیستی
- کد COI اختصاصی: NBCI08_0438
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 690
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه کردستان
عضو هیئت علمی گروه بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
چکیده
تریترپنوییدها بزرگ ترین گروه از محصولات طبیعی گیاهی هستندکه دارای تنوع زیادی می باشند. این متابولیت ها درصنعت داروسازی دارای اهمیت زیادی هستند. انواع اولئان ( بتاآمیرین)، اورسان(آلفا آمیرین) و داماران( دامارندیول) دارای بیشترین فراوانی در بین تریترپن ها می باشند. بتاآمیرین با اسکلت اولئانی توسط آنزیم بتاآمیرین سنتاز با پیش ماده اکسید و اسکوالن ایجاد می شود. ژن کدکننده این آنزیم در گونه های مختلف گیاهی از جمله در خانواده Asteraceae در دوجنس Aster و Artemisia توالی یابی شده است. هدف از مطالعه بررسی بیوانفورماتیکی ژن مزبور می باشد. توالی های آمینو اسیدی بتاآمیرین مربوط به چندین خانواده گیاهی ازپایگاه اطلاعاتی NCBI دریافت شد، سپس همردیفی توالی ها با استفاده از نرم افزار clustalW صورت گرفت و درخت فیلوژنی این پروتئین رسم گردید. نتایج نشان می دهد که پروتئین بتاآمیرین در خانواده Asteraceae رابطه فیلوژنی نزدیکتری با جنس Solanum از خانواده Solanaceae و جنس Gentiana از خانواده Gentiaceae دارد. سایز این پروتئین دربین گیاهان تحت بررسی در محدوده 779-755 اسیدآمینه است. بیشترین وزن آن متعلق به گونه Betula platyphylla می باشد. نقطه ایزوالکتریک این پروتئین در محدوده 7-6 است و بیشترین شاخص الیفاتیک که به عنوان یک عامل مثبت برای افزایش مقاومت حرارتی می باشد مربوط به گونه Gentiana stramineaاست.کلیدواژه ها
بتاآمیرین، تری ترپن، Asteraceae، بیوانفورماتیکمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.