بررسی الگوی بیان ژن های خانواده MYB در مراحل نموی آرابیدوپسیس براساس خوشه بندی فازی

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 560

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI08_0368

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

چکیده مقاله:

در پژوهش حاضر، نقش عوامل رونویسی به عنوان تنظیم کننده های الگوی بیان ژن های خانواده MYB (یکی از بزرگترین خانواده های عوامل رونویسی) در 45 مرحله مختلف نموی گیاه آرابیدوپسیس به روش فازی مورد بررسی قرار گرفت. برای این منظور با بکارگیری نرم افزار GeneExpress1.0 (برمبنای الگوریتم FCM) بررسی بیان ژن ها و خوشه بندی انجام شد.مطابق با نتایج، ژن های خانواده MYB از نظر میزان بیان در 10 خوشه تقسیم بندی شدند و برای هر خوشه نمودار الگوی بیان بدست آمد.تجزیه و تحلیل نمودارهای الگوهای بیان بدست آمده نشان داد که بیان تعدادی از ژن های این خانواده در مراحل خاصی ازنمو دستخوش نوسانات( کاهش یا افزایش) زیادی شده که نشان دهنده اهمیت آن ها در این مراحل خاص نموی، می باشد. همچنین در این تحقیق، ژن های این خانواده براساس نوسانات میزان بیانشان در سه گروه مجزا:1)ژن های با افزایش بیان در مراحل مختلف نمو2) ژن های با افزایش بیان در مراحل خاصی از نمو و 3) ژن های با بیان همیشگی در مراحل مختلف نمو، تقسیم بندی شدند.

نویسندگان

سارا فرنوش فر

دانشجوی کارشناسی ارشد دانشگاه پیام نور تهران

تهمینه لهراسبی

هیئت علمی پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری

پویا صبح بیداری

دانشکده الکترونیک و علوم کامپیوتر دانشگاه ریسون تورنتو، کانادا

فروغ سنجریان

دانشگاه پیام نورتهران، هیئت علمی پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Eisen, M.B., Brown, P.O., 1999. DNA arrays for analysis of ...
  • Guo, A., He, K., Liu, D., Bai, S., Gu, X, ...
  • Katiyar, A, Smita, Sh, Lenka, K.S, Rajwanshi, R., Chinnusamy, V., ...
  • Lohrasebi , T. 2010. Global expression analysis of arabidopsis acid ...
  • Rahaei, M., Naghavi, M., Alizadeh, H., Malbobi, M., Abdemishani, S., ...
  • Tanay A., Sharan, R., Shamir, R., 2002. Discovering statistically significant ...
  • نمایش کامل مراجع