مقایسه تنوع هاپلوتایپی برخی ژنوتیپ های سیب منطقه زاگرس مرکزی با استفاده از ژنوم کلروپلاست
- سال انتشار: 1392
- محل انتشار: هشتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران و چهارمین همایش ملی امنیت زیستی
- کد COI اختصاصی: NBCI08_0147
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 525
نویسندگان
دانشجوی سابق کارشناسی ارشد
استاد، دانشجوی کارشناسی ارشد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
عضو هیئت علمی موسسه بیوتکنولوژی کشاورزی کرج
دانشیار و دانشجوی کارشناسی ارشد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
چکیده
دی.ان.ا کلروپلاستی 11 نمونه سیب (Malus spp) برای مشخص کردن هاپلوتایپهای آنها با کاربرد روش PCR-PFLP بررسی شد. از مزایای اصلی این روش تحلیل راحت، صرفه جویی در زمان و هزینه ، تکرار پذیر بودن آن میباشد. تقریباً 5340bp از ژنوم کلروپلاست با کاربرد چهار جفت آغازگر عمومی کلروپلاست (BIB2, KIK2, CD و TF) و دو آنزیم برشی محدودگر (MseI و EcoRI) بررسی گردید و از ژل آگارز برای تفکیک باندها استفاده شد. قطعه تکثیری آغازگر CS به علت عدم داشتن جایگاه برش در این بررسی قابل بهره برداری نبود اما قطعه تکثیری توسط آغازگرهای BIB2, KIK2 حالت چند شکلی نشان داد و آغازگر TF هیچ قطعه ای را تکثیر ننمود. تمام جهشهای شناسایی شده حذف - اضافه در محدوده 40BP-10 بودند. ترکیب تمام جهشها چهار هاپلوتایپ (H3, H2, H1 و H4) را در نمونه های مورد بررسی معرفی نمود. معلوم گردید که بیشترین فراوانی هاپلوتایپ مربوط به H1 با حدود 36/4% فراوانی میباشد. سایر هاپلوتایپها دارای فراوانی تقریباً نزدیکی به هم بودند. اطلاعات تنوع دی.ان.ا کلروپلاستی میتواند میتواند برای مطالعات فیلورژنتیکی در این گیاه به کار رود و چند شکلیهای مشخص شده در نوم سیتوپلاسمی با روش PCR-PFLP می تواند به درک وراثت مادری در سیب کمک کند.کلیدواژه ها
Malus، هاپل.نتیپ، PCR-PFLP آغازگر عمومی کلروپلاست ، آنزیم برشی محدودگراطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.