بررسی هم تنظیمی و هم بیانی تعدادی از ژن های پاسخ دهنده به تنشهای زیستی و غیرزیستی با ژن LTP در گیاه آرابیدوپسیس
سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 464
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0124
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
چربیها، نقشهای کلیدی مختلفی در مکانیزمهای درون گیاه دارند. LTP: پروتئینهای کوچک و ضروری در تنشها هستند و مولکولهای آبسزیک اسید (ABA) مسئول بیان ژنهای LTP در مسیر سیگنالی است. جهت بررسی هم تنظیمی و هم بیانی تعدادی از ژن های پاسخ دهنده به تنشهای زیستی و غیرزیستی با ژن LTP، ژن های با بیشترین همبستگی و هم بیانی تحت تنشهای زیستی و غیرزیستی با p.VALUE=0.01 در گیاه آرابیدوپسیس با استفاده از پایگاه GENEVESTIGATOR انتخاب گردیدند. نتایج Co-Expression مشخص نمود که ژن AT2G05520 با ژن LTP5 بیشترین همبستگی را دارد. نتایج Hierarchical Clustering برای ژنهای هم بیان با ژن LTP5 در بافتهای گیاه آرابیدوپسیس در هر دو شرایط افزایش و کاهش بیان نشان داد که بیشترین بیان در ساقه است. ژنهای AT2G03980, AT3G45780, AT3G28040 و AT2G15960 با ژن LTP5 در یک گروه قرار گرفتند. نتایج ماتریس bio-cluster نشان داد که بیشترین میزان بیان ژنهای همبسته در مراحل جوانه زنی است و بزرگترین بیوکلاستر مربوط به افزایش بیان، یک ماتریس 5x21 بود. در شرایط تنش زیستی با اعمال p.syringae ، تنش خشکی بعد 24 ساعت، تنش اسمزی و تنش نور بیشترین کاهش بیان را نشان دادند و بزرگترین بیوکلاستر تولید شده مربو ط به کاهش بیان، یک ماتریس 8x12 بود.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
پرویز حیدری
دانشجوی دکتری رشته اصلاح نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
سیروان سعیدی آذر
دانشجوی کارشناسی ارشد رشته اصلاح نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :