خوشه بندی عملکردی ژن های اسید فسفاتاز گیاه آرابیدوپسیس تالیانا بر اساس الگوی بیان در طول زمان تحت تاثیرغلظت فسفات
- سال انتشار: 1390
- محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
- کد COI اختصاصی: NBCI07_0762
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 598
نویسندگان
پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری
پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری
دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی، گروه مهندسی پزشکی.
دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی، گروه مهندسی پزشکی.
چکیده
امروزه با وجود حجم انبوهی از داده های بیانی ژن ها مربوط به موجودات مختلف استفاده از روش های محاسباتی و رایانه ای برای فهم عملکرد ژن ها مورد نیاز است. می توان از مجموعه داده های بیانی به منظور دریافت اطلاعات مفید مانند الگوی رفتاری ژن ها در ارتباط با شرایط محیطی و همچنین برهم کنش های بین آن ها استفاده کرد. در این پروژه به منظور بررسی الگوی بیان ژن های اسید فسفاتاز در طول زمان رشد در حضور یا عدم حضور فسفات در محیط کشت نیمه کمی استفاده شد. سپس خوشه بندی داد ههای بیانی با استفاده ازالگوریتم RT-PCR از توالی های یگانه در واکنش انجام شد و ژن ها بر اساس شباهت در الگوی رفتار ی خوشه بندی گردیدند. این آزمایش ها و تجزیه و Fuzzy C Means تحلیل داده های حاصل نشان داد بر اساس الگوی زمانی بیانی ژن های اسید فسفاتاز در ریشه و اندام هوایی به چندین گروه قابل تقسیم هستند. همچنین، این بررسی نشان داد که تنها معدودی از ژن ها رفتارهای بیانی مشابهی در ریشه و اندام هوایی دارند و یا در خوشه های بیانی مشابهی قرار می گیرند.کلیدواژه ها
اسید فسفاتازها، آرابیدوپسیس ،FCM داده های بیانی، خوشه بندی ژن ها، الگوریتممقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.