وضعیت تنوع ژنتیکی جدایههای ویروس ایکس سیبزمینی از استان همدان

سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 424

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI07_0532

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

چکیده مقاله:

ویروس ایکس سیبزمینی (Potato virus X-PVX) گونه شاخص جنس Potexvirus از خانواده Flexiviridae می باشد . این ویروس دارای پیکره رشتهای تاحدودی خمش پذیر بطول 515 و عرض 13 نانومتر است. این ویروس در سیبزمینی و گوجهفرنگی موجب بیماری و کاهش محصول میگردد. طی یک بررسی در سالهای 1389 و 1390 ، تعداد 271 و 545 نمونه بترتیب علائمدار و تصادفی از 15 مزرعه در استان همدان جمعآوری شده و آلودگی آنها به ویروس PVX بکمک روشDAS-ELISA و با استفاده از آنتی بادی اختصاصی ویروس (بیوربا سوئیس) مورد بررسی قرار گرفت. نمونههای دارای واکنش مثبت در آزمون الایزا انتخاب شده و در گلخانه روی گیاه مایهزنی مکانیکی شده آغازگرهای اختصاصی طی واکنش زنجیرهای پلیمراز به روش رونوشت برداری برگردان (RT-PCR) تکثیر گردیده و پس از الکتروفورز در ژل آگارز و جداسازی از سایر اجزا واکنش، تعیین توالی گردید. توالی نوکلئوتیدی دو جدایه فوق با توالی CPمربوط به 60 جدایه خارجی این ویروس مقایسه شد. نتایج حاصل نشاندهنده وجود 93 تا 97/5 درصد یکنواختی توالی نوکلئوتیدی این دو جدایه با توالی CP جدایه های خارجی ویروس بود. دو جدایه PVX-H و 41 PVX-H 7 دارای بیشترین یکنواختی (بترتیب 97/5 و 96/8 درصد ) با جدایه هایی از کشورلیتوانی و اوکراین بوده و در درخت تبارزایی جزو تیپ ایکس جدایههای این ویروس گروهبند ی شده و کمترین یکنواختی (بترتیب 93 و 93/5 درصد) را با جدایه های آمریکا نشان دادند. این موضوع نشان دهنده نزدیکی جدایه های ایرانی PVXبه جدایه های اروپایی است . این اولین گزارش از مطالعه جایگاه تبارزایی ژنتیکی جدایه-های ایرانی ویروس PVX از مزارع سیب زمینی استان همدان میباشد.

کلیدواژه ها:

ویروس ایکس سیب زمینی ، تنوع ژنتیکی ، توالی نوکلئوتیدی

نویسندگان

ندا شکراللهی

دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد دامغان

رضا پوررحیم

بخش تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، تهران.

شیرین فرزادفر

بخش تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، تهران.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Bercks, R, 1970. Potato virus X. CMI/AAB Descriptions of plant ...
  • Clark, M.F., and Adams, A.N. 1997. Characteristics of microplate method ...
  • Cox, B.A. and Jones, R.A. 2010. Genetic variability in the ...
  • Komatsu, K., Kagiwada, S., Takahashi, T., Mori, T., Yamaji, Y., ...
  • Sutic, D.D., Ford, R.E., and Tosic, M.T. 1999. Hand book ...
  • نمایش کامل مراجع