بررسی تغییرات در الگوی بیان ژن در طی تنشهای شوری و اکسیداتیوبا استفاده از تجزیه و تحلیل داده های میکرواری در آرابیدوپسیس
- سال انتشار: 1390
- محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
- کد COI اختصاصی: NBCI07_0523
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 1030
نویسندگان
بخش زراعت واصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
بخش زراعت واصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
گروه پژوهشی بیوانفورماتیک، پژوهشکده سبز، دانشگاه قم
بخش زراعت و اصلاح نباتات دانکده کشاورزی دانشگاه صنعتی اصفهان
چکیده
تنشهای غیر زنده رشد و توسعه گیاهان را تحت تاثیر قرار میدهند. واکنشهای گیاه در برابر آنها با تغییرات زیادی در شبکههای پیچیده ژن همراه است. در پژوهش حاضر تغییرات در الگوی بیان ژنها در شرایط تنش شوری و اکسیداتیو و ارتباط بین آنها در گیاه آرابیدوپسیس مورد بررسی قرار گرفت. دادههای خام شرایط کنترل و تنش از پایگاه دادهTAIR گرفته شد .جهت تعیین تفاوت معنیداری بیان ژنها بین شرایط کنترل و تنش از روش t-test استفاده شد. نتایج نشان داد که به ترتیب بیان 1721 و 1084 ژن پس از تنش شوری و اکسیداتیو در برگ افزایش یافته است. همچنین بیان 83 ژن در هر دو تنش کارکردی ژنهایی که در هر دو تنش افزایش بیان داشتهاند نشان داد که نزدیک به 38 درصد از آنها در گروه های RNA پروتئین، پیام رسانی وDNAدخالت دارند. شوری و اکسیداتیو افزایش یافت که نشان دهنده ارتباط قوی بین پاسخهای تنش شوری و اکسیداتیو میباشد . آنالیز ترکیبکلیدواژه ها
تنش، میکرواری، آرابیدوپسیس، بیوانفورماتیکمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.