چندشکلی ادغامی رتروترنسپوزونها و تنوع ژنتیکی در ارقام تجارتی گندم نان ایران

رتروترنسپوزونها فراوانترین و گسترده ترین عناصر جابه جا شونده در ژنوم یوکاریوتها میباشند. چندشکلی ادغامی و شیوع آنها درژنومهای گیاهی استفاده از آنها را به عنوان نشانگرهای ملکولی ایدهال میسازد. به منظور مطالعه فعالیت خانوادههای مختلف رتروترنسپوزونی و چندشکلی ادغامی حاصل از آنها در 50 رقم مختلف گندم نان(Triticum aestivum L.)از نشانگرهایIRAP و REMAP استفاده شد. نتایج نشان داد که بیشتر رتروترنسپوزونهای مورد استفاده درارقام گندم نان مورد مطالعه فعال بوده و درداخل همدیگر و همچنین در نزدیک توالیهای ریزماهواره در ژنوم گندم هگزاپلوئید ادغام میشوند. از 26 آغازگر مورد استفاده،10 آغازگر( 4 آغازگرIRAP و 6 آغازگر REMAP) الگوی نواری واضح و قابل امتیازدهی تولید کردند. در مجموع 137 مکان تولید شدکه 103 مکان چندشکل بود. آغازگر 2108 (مبتنی بر خانواده رتروترنسپوزونیWilma-Bagy-2) و ترکیب آغازگری840- 2109 (مبتنی بر خانواده رتروترنسپوزونیDaniela) بترتیب بیشترین وکمترین تعداد مکان ژنی را تولید کردند. دندروگرام حاصل ازتجزیه کلاستر به روش UPGMAمبتنی بر ضرایب تشابه دایس، ارقام را در چهار گروه اصلی متمایز نمود. بیشترین و کمترینتشابه ژنتیکی بین ارقام به ترتیب 0.87 (کرج و بیات) و0.59 (سیستان و گاسپارد) بود. میانگین تشابه ژنتیکی ارقام0.63 بود.ارقام با فاصله ژنتیکی مناسب میتوانند بطور بالقوه به عنوان والدین تلاقی در برنامههای به نژادی گندم مورد استفاده قرار گیرند.

کلیدواژه ها:

گندم نان ، نشانگرهای IRAPو REMAP تجزیه کلاستر