شناسایی ژنهای درگیر در گامتوفیت ماده آرابیدوپسیس با استفاده از آنالیز شبکه های ژنی

  • سال انتشار: 1390
  • محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
  • کد COI اختصاصی: NBCI07_0452
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 529
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

بتول حسین پور

دکتر؛ موسسه کشاورزی، سازمان پژوهشهای علمی و صنعتی ایران، تهران، ایران

وحید حاجحسینی

دکتر؛ بخش بیوتکنولوژی، دانشکده علوم، دانشگاه تهران، ایران

رفیعه کشفی

دانشجوی کارشناسی ارشد؛ بخش زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، ایران

اسماعیل ابراهیمی

استادیار؛ بخش زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز ، ایران

چکیده

اگرچه گامتوفیت ماده در آنژیوسپرم شامل هفت سلول میشود، اما دارای شبکه بیولوژیکی پیچیدهای است. در این تحقیق با استفاده از دادههای ریزآرایه گامتوفیتهای ماده و به کار گیری آنها درون دیتابیس آرابیدوپسیس، یک نقشه اثر متقابلی پروتئین - پروتئین از گامتوفیت ماده بر اساس فرآیندهای بیولوژیکی و عملکرد مولکولی پروتئینها ساخته شد. گروههای کارکردی و بیولوژیکی از شبکه، نظیر فیتوهورمونها، دفاع گیاه، مرگ سلولی، حاملها و هیدرولیززها مورد تحقیق قرار گرفتندتا اعضای مهم و حیاتی مشخص گردند. به طور قابل توجهی متوجه ارتباطات جدید و مهمی میان ژنهایی نظیر ATP disulfate isomerase و Pathogenesis-related Protein 4, ECA3, dihydroflavonol reductase شدیم. موقعیتهای ژنهای با بیان بالا و پایین گامتوفیت ماده در شبکه و رابطه آنها با مسیرهای بیولوژیکی نمایش داده شد.

کلیدواژه ها

گامتوفیت ماده، اثرمتقابل پروتئینها، شبکه، آرابیدوپسیس

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.