استفاده از ترکیب معیار همبستگی، شبکه های عصبی و الگوریتم ژنتیک برای انتخاب چند شکلی های تک نوکلئوتیدی(SNP)مهم

سال انتشار: 1390
محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
کد COI اختصاصی: NBCI07_0401
زبان مقاله: فارسی
تعداد مشاهده: 606

دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

حمید صنعت نما

استادیار بخش مهندسی کامپیوتر دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی کرمان

علی اسماعیلیزاده کشکوئیه

دانشیار بخش علوم دامی دانشگاه شهید باهنر کرمان

فریده هلاکو

دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی ITدانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی کرمان

مهدی افتخاری

استادیار بخش مهندسی کامپیوتر دانشگاه شهید باهنر کرمان

چکیده

در طول دههی گذشته، استفاده از روشهای انتخاب ویژگی در بیوانفورماتیک به یک نیاز اساسی برای ساخت مدل تبدیل شده است. این امر به خاطر بالا بودن ابعاد دادهها در علوم مختلف بیوانفورماتیک، مثل انتخاب SNP. ها، میباشدSNPهااطلاعات مفیدی را جهت تشخیص ژنهای مرتبط با بیماریهای دارای مکانیزم توارثی پیچیده مثل انواع سرطان، دیابت،بیماریهای عروقی و برخی انواع بیماریهای ذهنی فراهم میکنند. بنابراین، استفاده از روشهای کاهش ابعاد اجتناب ناپذیر شده است. در این مقاله، ما از یک روش ترکیبی جهت انتخابSNPهای مهم موجود در یک مجموعه از بانکهای اطلاعاتی استفاده کردهایم. در روش پیشنهادی ما، ابتدا الگوریتم انتخاب ویژگی مبتنی بر همبستگی اجرا میشود و تعداد کمتری از ویژگیهای ورودی را انتخاب میکند. سپس این ویژگیها به عنوان ورودی مرحلهی دوم، یعنی شبکهی عصبی استفاده می شوند. ویژگیهای انتخاب شدهی نهایی، در واقع مهمترین SNPهای موجود در بانک اطلاعاتی میباشند. نتایج حاصله نشان دهندهی دقت قابل قبول و زمان محاسباتی مناسب الگوریتم پیشنهادی در تشخیص SNPهای مهم میباشد.

کلیدواژه ها

انتخاب ویژگی، شبکهی عصبی، معیار همبستگی

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.