همسانه سازی ژن پروتئین پوششی و تعیین جایگاه تکاملی دوجدایه های ایرانی ویروس سیب زمینی X
- سال انتشار: 1390
- محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
- کد COI اختصاصی: NBCI07_0333
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 567
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی دانشگاه شهید باهنر کرمان
عضو هیات علمی دانشگاه شهید باهنر کرمان
عضو هیات علمی دانشگاه شهید باهنر کرمان
عضو هیات علمی دانشگاه شهید باهنر کرمان
چکیده
یکی از عوامل مهم که در سیب زمینی موجب خسارت می شود ویروس x سیب زمینی (PVX) می باشد. این ویروس از جنس Potexvirus با پیکره های ایزومتریک و ژنوم RNA تک لا و مثبت می باشد. در این بررسی تعداد 150 بوته دارای علائم ویروسی از مزارع سیب زمینی استان های کرمان، اصفهان، یزد و هرمزگان نمونه با استفاده از آزمون ساندویچ الایزا مورد بررسی قرار PVX برداری شد. نمونه ها ابتدا با آنتی سرم اختصاصی گرفتند. از بین نمونه های مثبت دو جدایه انتخاب و ژن پروتئین پوششی به اندازه 714 جفت باز با استفاده از تکثیر شدند. پس از همسانه سازی و تعیین ترادف ژن پروتئین پوششی، RT-PCR آغازگر اختصاصی در روش درخت فیلوژنی رسم شد. نتایج حاصل بیانگر آن است که جدایه های ایرانی و تعدادی از جدایه های گزارش شده در تقسیم گردید. دو جدایه IIB و IIA نیر به دو زیر گروه II تقسیم می شوند. گروه II و I دنیا به دو گروه اصلی ایرانی به صورت مجزا در این دو زیر گروه قرار گرفتند. کمترین و بیشترین شباهت ترادف نوکلئوتیدی جدایه های بین جدایه CP 99 می باشد. مقایسه ترادف نوکلئوتیدی و آمینو اسیدی ژن / 93 و 2 / ایرانی با یکدیگر به ترتیب 3 بیانگر آن است که این ژن از ترادف حفاظت شده زیادی برخوردار می باشد.کلیدواژه ها
سیب زمینی X پروتئین پوششی ، درخت فیلوژنتیکی، ویروساطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.