بررسی مولکولی جدایه های ویروس Y سیب زمینی مجزا شده از میزبان های ثانویه
- سال انتشار: 1390
- محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
- کد COI اختصاصی: NBCI07_0214
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 525
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
دانشیار بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
دانشیار بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
دانشیار بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
چکیده
ویروس Y سیب زمینی (PVY) دارای دامنه میزبانی وسیعی در میان گیاهان خانواده Solanaceae می باشد. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های این ویروس در بین میزبان های ثانویه در طول سالهای زراعی 1387 تا 1389 از مزارع گوجه فرنگی، فلفل، بادمجان، لوبیا، توتون و علف های هرز مزارع سیب زمینی 6 استان نمونه برداری بعمل آمد. آلودگی نمونه ها با RT-) استفاده از روش های سرولوژیکی (آزمون های الایزا به دو روش الایزای غیر مستقیم 1 و مستقیم ترکیبی 2) و مولکولی تعیین گردید. از بین جدایه ها تعداد 14 جدایه براساس مناطق نمونه برداری و میزبان ثانویه انتخاب گردیدند. ژن (PCR3 تکثیر و RT-PCR پروتئین پوششی این جدایه ها به اندازه 1201 جفت باز با استفاده از آغازگر های اختصاصی در روش سپس همسانه سازی شد. ترادف نوکلئوتیدی قطعات بدست آمده با ترادف های مشابه موجود در بانک ژن مقایسه گردیدند.تنها یک جدایه ایرانی I قرار می گیرند، در گروه II و I در دو گروه اصلی PVY نتایج حاصل بیانگر آن است که، جدایه های واقع می شوند. کمترین II مجزا شده از گیاه تاج ریزی) وجود دارد، در حالیکه بقیه جدایه های ایرانی در گروه ) KER.JI.Soو KER.JI.So و MAZ.BEH.Ta و بیشترین تشابه نوکلئوتیدی در بین جدایه های ایرانی به ترتیب 78 % در بین جدایه های بین دو CP برآورد گردید. بالاترین میزان تشابه اسیدهای آمینه ژن FAR.OG.Ph و FAR.SI.Ph %99/6 در بین جدایه هایدارای میزبان PVY 99 % می باشد. نتایج این تحقیقات بیانگر آن است که / به میزان 7 HAM.DE.So و FAR.SI.Ph جدایه های متعددی در ایران بوده و از تنوع ژنتیکی بالائی نیز بر خوردار می باشد.کلیدواژه ها
سیب زمینی، پروتئین پوششی، تنوع ژنتیکی، میزبان های ثانویه. Y ویروساطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.