CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

ارائه تحلیل سیستماتیک از رفتار دینامیک متابولیسم مرکزی در باکتری اشریشیا کلی: مدلسازی سینتیکی و شبیه سازی

عنوان مقاله: ارائه تحلیل سیستماتیک از رفتار دینامیک متابولیسم مرکزی در باکتری اشریشیا کلی: مدلسازی سینتیکی و شبیه سازی
شناسه ملی مقاله: NBCI07_0183
منتشر شده در هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران در سال 1390
مشخصات نویسندگان مقاله:

محمد جعفر خطبیی پور - اصفهان، خیابان هزار جریب، دانشگاه اصفهان، دانشکده علوم و فناوری های نوین، گروه بیوتکنولوژی
محمد علی اسداللهی - اصفهان، خیابان هزار جریب، دانشگاه اصفهان، دانشکده علوم و فناوری های نوین، گروه بیوتکنولوژی
گوتام وموری - گروه بیولوژی سیست مها، دپارتمان مهندسی شیمی و بیولوژی، دانشگاه صنعتی چالمرز، سوئد

خلاصه مقاله:
به کارگیری قواعد مهندسی متابولیک در طراحی و تولید کارخانه های سلولی کارآمد، به میزان قابل توجهی به توانایی ما در ارائه تحلی لهای سیستماتیک از رفتار متابولیسم مرکزی کربن در توزیع کربن بین مسیرهای متابولیکی مختلف وابسته است. متابولیسممرکزی کربن شامل مسیرهای گلیکولیز، پنتوز فسفات و تری کربوکسیلیک اسید تنه اصلی همه مسیرهای متابولیکی در سلول به حساب می آید و کلیه مسیرهای فرعی از آن نشأت می گیرند. در این تحقیق یک مدل سینتیک از تمامی واکنش های متابولیسممرکزی کربن در باکتری اشریشیا کلی ارائه و پس از تخمین پارامترهای سینتیکی مدل با استفاده از داد ههای آزمایشگاهی، رفتار شبکه متابولیک مرکزی در پاسخ به پالس گلوکز شبیه سازی می گردد. از طریق مقایسه جواب مدل با نتایج آزمایشگاهی نشان دادهمی شود که تطابق قابل قبولی بین مدل و شبکه متابولیک وجود دارد. با تحلیل نمودا رهای غلظت-زمان متابولیت ها، نقاط کلیدی در تنظیم توزیع جریان کربن تخمین زده م یشوند. به عنوان نمونه، فسفوانول پیروات یک متابولیت کلیدی در کنترل جریان ورودیگلوکز تشخیص داده می شود. همچنین م یتوان از اصول و روابط موجود در تحلیل کنترل متابولیک، در کنار داد ههای حاصل از شبیه سازی مدل، برای محاسبه ضرایب کنترل متابولی تها بر روی واکن شهای مختلف شبکه استفاده کرد.

کلمات کلیدی:
زیس تشناسی سامانه ها، مهندسی متابولیک، متابولیسم مرکزی کربن، مدل سازی سینتیک، اشریشیا کلی

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/375637/